【摘 要】
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研究背景及目的病毒感染及相关疾病是异基因造血干细胞移植（allo-HSCT）后的重要并发症,其病原学诊断需依赖实验室检查。传统的病原体检测方法敏感性较差、费时,且部分患者无法耐受组织活检等侵入性操作的风险。目前,通过实时荧光定量聚合酶链反应（RQ-PCR）方法检测组织或/及体液中的病毒被认为是病毒相关疾病的诊断依据,但粪便样本中病毒RQ-PCR检测对诊断肠道病毒相关疾病的临床价值暂不明确。宏基因组
【基金项目】
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广东省重点领域研发计划项目（2019B020236004,201707010213）； 国家自然科学基金（82070190,81400141）；
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研究背景及目的病毒感染及相关疾病是异基因造血干细胞移植（allo-HSCT）后的重要并发症,其病原学诊断需依赖实验室检查。传统的病原体检测方法敏感性较差、费时,且部分患者无法耐受组织活检等侵入性操作的风险。目前,通过实时荧光定量聚合酶链反应（RQ-PCR）方法检测组织或/及体液中的病毒被认为是病毒相关疾病的诊断依据,但粪便样本中病毒RQ-PCR检测对诊断肠道病毒相关疾病的临床价值暂不明确。宏基因组二代测序技术（mNGS）作为一项新的分子检测技术近年来引起人们的重视。目前,中枢神经系统（CNS）感染的病原学诊断难度仍较大,mNGS在allo-HSCT后CNS感染中病原体检测的临床意义尚不明确。本研究主要探讨以下两个方面:1、在allo-HSCT后CNS感染患者中比较mNGS和传统方法对病原体检测的临床价值;2、探讨粪便样本中病毒RQ-PCR检测对allo-HSCT后肠道病毒相关疾病的诊断价值。方法1、在allo-HSCT后CNS感染患者中比较mNGS和传统方法对病原体检测的临床价值:选择2016年7月1日至2019年3月31日在南方医科大学南方医院接受allo-HSCT的血液病患者53例,对其脑脊液（CSF）样本中的病原体进行检测,检测方法包括mNGS和传统方法,比较mNGS和传统方法对病原体检测的敏感性和特异性。2、探讨粪便样本中病毒RQ-PCR检测对allo-HSCT后肠道病毒相关疾病的诊断价值:选择2016年1月1日至2020年11月30日在南方医科大学南方医院、广州市第一人民医院和广东省中医院接受allo-HSCT的81例血液病患者作为研究对象,对其肠道活组织样本及粪便样本中的病原体进行检测,分析粪便样本中病毒RQ-PCR检测对allo-HSCT后肠道病毒相关疾病的诊断价值。统计学分析运用 SPSS statistics 19.0（SPSS,Chicago,IL）和 R version 3.4.3（R Development Core Team,Vienna,Austria）对相关数据进行统计分析。各组数据均进行正态性检验。以最终诊断为金标准,应用Pearson X2检验或Fisher’s确切检验比较mNGS与传统检测方法检测病原体的敏感性和特异性。以病理学诊断为金标准,分析粪便样本中病毒RQ-PCR检测对诊断allo-HSCT后肠道病毒相关疾病的敏感性、特异性。应用竞争风险分析评估allo-HSCT后CNS感染的累计发生率。所有P值采用双侧检验,P<0.05为差异认为有统计学意义。结果1、在allo-HSCT后CNS感染患者中比较mNGS和传统方法对病原体检测的临床价值:（1）mNGS与传统检测方法诊断移植后CNS感染的敏感性分别为97.1%和82.9%,特异性分别为94.4%和100%;（2）66.0%患者诊断为CNS感染,病毒是最常见的病原体。移植后2年CNS感染和CNS病毒感染的累计发生率分别为6.59%和5.29%;2、探讨粪便样本中病毒RQ-PCR检测对allo-HSCT后肠道病毒相关疾病的诊断价值:（1）在allo-HSCT后肠道GVHD合并难治性腹泻的患者中,66.7%患者诊断肠道病毒相关疾病,CMV相关疾病是最常见的类型;（2）粪便样本中病毒RQ-PCR检测对诊断肠道CMV和EBV相关疾病的敏感性分别为87.9%和87.5%,特异性分别为95.8%和98.2%;（3）外周血样本中病毒RQ-PCR检测对诊断肠道CMV和EBV相关疾病的敏感性分别为60.6%和20.8%,特异性分别为20.8%和31.6%。结论1、mNGS对诊断allo-HSCT后CNS感染具有一定的临床意义,病毒是allo-HSCT后CNS感染中最常见的病原体;2、在allo-HSCT后肠道GVHD合并难治性腹泻患者中,肠道病毒相关疾病是常见的并发症,CMV相关疾病最常见。粪便样本中病毒RQ-PCR阳性有助于诊断肠道病毒相关疾病,而外周血病毒RQ-PCR阳性不能用于诊断肠道病毒相关疾病。
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