自2002年联合国开发计划署首次提出“绿色发展”后,其一直被学术界认为是实现经济发展和环境保护有机结合的关键道路。农业经济在发展过程中面临着要素资源约束和环境污染排放等问题日益严峻,如何实现“高碳性粗放式”发展模式向“绿色集约式”发展模式的转型升级,重视资源的可持续性利用和提高农业要素配置效率是推动农业绿色可持续发展的关键之举。目前,我国农业农村面临着资源硬约束日益加剧,环境污染问题突出,农业生产要素错配,绿色效率低且地区差异大等问题,制约了农业资源的合理利用和农业绿色可持续发展。因此,深入探究农业生产要素错配对农业绿色生产效率具有重要的现实意义,将有利于改善农业生产要素错配,提高农业资源利用,促进农业经济绿色可持续发展。本研究从生产要素错配的视角出发,探究农业生产要素错配对农业绿色生产效率的影响,为提高农业绿色生产效率提供新的理论支撑和经验证据。首先,本研究从生产要素错配的视角出发,结合经济增长理论和资源错配理论来构建农业经济增长的一般分析框架,将要素“扭曲价格”纳入到农业生产函数中来分析农业要素错配对农业绿色生产效率的影响机制,并基于理论分析提出本研究的研究假说。其次,选取中国30个省份作为分析对象,测算出各省份的农业资源错配指数和农业绿色全要素生产率指数,应用ArcGIS软件分析中国农业生产要素错配和农业绿色生产效率的时空演变特征和发展趋势。再次,根据已有的理论分析和研究假说构建面板数据,采用空间计量模型来估计农业资源错配对农业绿色生产效率的空间溢出效应,并且根据农业可持续发展分区和土地流转水平来进行异质性分析。最后,采用中介效应模型进一步检验了农业生产要素错配对农业绿色生产效率的影响机制。研究结果表明,第一,农业资本错配、劳动力错配和土地错配在时间和空间上体现出不同的空间分布特征,但总体上都呈现出要素错配不断改善的发展趋势。农业绿色生产效率在研究范围内实现了快速增长,北方以及东部沿海地区增长速度要大于中西部地区,呈现出东北西北强而中西部地区较弱的空间分布格局。第二,从估计结果来看,农业生产要素错配对农业绿色生产效率的影响在不同地区具有显著的正向空间溢出效应,即本区域的农业绿色生产效率不仅会受到本区域生产要素错配的影响还会受到其他邻近区域生产要素错配的影响。同时,农业生产要素错配对农业绿色生产效率有显著的负向影响,即农业资源错配会阻碍农业绿色生产效率增长。从空间效应分解结果来看,间接效应要大于直接效应,即说明本区域内要素错配对本区域农业绿色生产效率的影响要大于其对邻近地区农业绿色生产效率的影响。第三,农业资源错配会通过制约农业产业结构升级来阻碍农业绿色生产效率增长,表现为过去“粗放式”农业发展难以摆脱投入冗余和污染过度的生产模式,农业污染排放量更高,从而阻碍了农业绿色生产效率增长。农业资源错配会制约农业绿色技术创新来阻碍农业绿色生产效率增长,表现为面临农业生产要素错配的农业生产主体其进行绿色技术创新的意愿和行为会降低,从而会阻碍农业绿色生产效率增长。