在中国政府推动农民合作经济发展，规范合作经济组织制度，以及提高基于农民专业合作社制度安排的农户交易效率的背景下，中国合作制度创新过程中出现诸如合作社经营效率较低、农户合作意识淡薄、合作行为倾向不强、农户农产品入市交易成本过高等问题，显著影响农户对不同交易制度安排的选择及行为倾向。同时，针对基于合作社框架的交易制度中出现的问题，相关领域学者和政策制定者提出建立“农超对接”模式、发展“家庭农场”，以及推动培养“职业化农民”等方式，作为有效解决农户生产、销售过程中存在的交易成本过高、生产效率较低，以及生产规模不经济、交易规模不经济问题的农业经营体系改革路径和制度安排。但更多学者认为，“以农民专业合作社为经营主体，构建‘产前-产中-产后’纵向一体化的合作交易制度”，是推动农户实现规模效益、增加农户农业家庭收入，以及有利于提高弱势群体（即中国小规模农户）组织化的基本制度安排。因此，推进以农民专业合作社为经营主体的合作交易制度改革与优化，促进以农民专业合作社为经营主体的农户合作发展道路走出困境，是中国未来农业组织制度创新与建设过程中需要解决的重要问题。本文以新制度经济学理论及交易费用理论为支撑，围绕2007年《中华人民共和国农民专业合作社法》实施以来我国农民专业合作社数量扩张中存在的主要问题，以“苹果种植户—果业合作社交易制度及其关系”为研究对象，在把握农民专业合作社产生和发展的制度背景和经济背景的基础上，根据规范分析基本原理（即超边际分析原理和交易成本比较分析原理），推理、形成论文的基本假设（即合作市场交易制度下农户交易成本<非合作市场交易制度下农户交易成本）。应用数理统计分析的相关原理及其模型方法，设计实证分析模型（包括均值检验、二元Probit、Tobit、Marginal Effect、两阶段DEA、有序Logit等），按照“农户合作交易模式选择意愿→农户合作交易模式选择行为→合作交易模式农户交易成本测定→合作交易模式农户生产效率评估→合作交易模式持续发展分析”的研究思路，对基本假设进行验证与修正的基础上，形成基于交易成本视角的农户合作交易制度分析体系，以及农户交易成本与农民专业合作社之间关系的实证分析原理及体系。基于研究目的，即交易成本视角，分析农户对以合作社为经营主体的合作交易制度的选择行为与规律，本文按照“文献综述与评价→提出问题→理论分析→实证分析→凝练形成研究结论→提出建议”的规范分析逻辑关系，将论文研究内容规划为四个部分、共九章：第一部分导言，包括第一章。主要是介绍论文的研究背景、凝练拟解决的问题、设计本文研究方案，具体包括研究背景，提出问题，文献综述与评价，设计研究目标与评估研究价值与意义，构建研究思路及技术路线，设计和选择研究方法、数据收集及分析方法，以及论文总结及创新之处。第二部分为理论分析体系，涵盖论文第二章和第三章。其中，第二章在对交易成本内涵与外延分析的基础上，对交易主体进行分类分析；借鉴超边际分析理论和交易成本比较分析理论，建立农户合作交易制度分析体系、农户非合作交易制度分析体系。第三章以高价值农产品生产者（即苹果种植户）为例，在系统分析苹果市场中交易主体、交易客体、交易渠道以及交易模式的基础上，建立高价值农产品生产者交易成本理论分析体系。在对选样背景与选样方法介绍基础上，对实证研究部分采用的样本数据进行描述性统计分析。以理论分析结论为基础，形成本文的基本假设，即合作交易制度下农户交易成本小于非合作交易制度下农户交易成本。第三部分为实证分析体系，包括论文第四章、第五章、第六章、第七章、第八章。其中，第四章基于苹果种植户交易成本理论，应用二元Probit模型，对影响苹果种植户合作市场交易制度选择意愿因素进行分析。第五章，基于苹果种植户交易成本理论，应用Tobit模型，结合边际效应测度方法，对影响苹果种植户合作市场交易制度选择行为因素进行分析。第六章，从交易成本视角，建立合作交易制度、非合作交易制度下农户交易成本测算体系，对基于两种交易制度的农户交易成本差异进行测定与比较分析。第七章，应用两阶段DEA-Tobit分析方法，构建semi-log模型，测度合作交易模式、非合作交易模式下农户的生产效率（包括技术效率、成本效率、规模效率，以及分配效率）；加入交易成本变量（包括信息成本、谈判成本、执行成本和运输成本），对两种交易制度下，影响农户成本效率因素进行比较分析。第八章，从合作社成员角度，探讨合作交易模式运营与持续发展中存在问题，探究制约以农民专业合作社为经营主体的合作交易制度持续运营的因素。第四部分阐述论文主要研究结论及其政策启示，即第九章。在借鉴发达国家合作组织制度成功运营的经验基础上，结合中国农户家庭经营小规模、分散化、流动性较弱，以及农民非职业化等特点，提出政策启示。主要包括：建议政府重视培育农户树立合作意识，规范合作社经营制度与相关法律制度；强化对合作交易制度的监管及信息披露，鼓励提高农户对合作社信任度与合作社管理事务的参与度，支持发挥农民专业合作社的市场功能（特别是连接农户与市场的功能），以及推进完善以农民专业合作社为主体的纵向一体化合作组织机制。主要研究结论包括六个方面：1.本文设计的交易成本比较分析数理模型研究结果表明：合作交易制度下的农户交易成本低于非合作交易制度下的农户交易成本。2.以苹果种植户和果业合作社交易制度为研究对象，将合作社提供的服务细分为13项，应用二元Probit模型，对影响农户合作交易模式选择意愿因素进行分析。结果表明，农户苹果种植面积越大、道路运输条件越差、获取农业贷款困难程度越高，农户越有可能愿意加入合作社；农户认为合作社提供的服务中，“稳定的果品收购”、“果品加工”、“果品贮藏”，以及“果品包装”等加工服务项目的重要程度越高，其加入合作社可能性越大。在交易成本方面，谈判成本和执行成本越高，农户的合作社参与意愿越强烈。3.按照交易成本理论原理，将交易成本细分为信息成本、谈判成本、执行成本、运输成本，应用Tobit模型，结合边际效应测度方法，对影响农户合作交易模式选择行为的因素进行分析。验证了交易成本是影响农户合作交易模式选择行为重要因素。其中，在反映谈判成本的变量中，苹果分级时间对苹果种植户选择通过合作社进行销售的苹果数量有显著积极影响作用；在反映执行成本的变量中，收到全部货款等待时间对苹果种植户选择通过合作社进行销售的苹果数量有显著积极影响作用；接待交易对象产生的费用，则对苹果种植户选择通过合作社进行销售的苹果数量有明显抑制作用。4.以高价值农产品生产者（即苹果种植户）交易成本理论分析体系为基础，采用统计数据分析法，实际测算并比较合作交易制度、非合作交易制度下，不同规模农户交易成本差异。以样本数据测度结果证明，农户从非合作交易模式转换为合作交易模式，可显著降低交易成本中的运输成本与谈判成本，户均年节省运输成本800元左右、降低由购买者违约所带给农户的损失约190元、节省苹果分级时间8.1小时（相当于一个工作日）。5.以苹果种植户为例，建立以投入为导向的成本最小化两阶段DEA-Tobit模型，测度并比较合作与非合作交易模式下农户的生产效率；基于两种交易模式，构建semi-log模型，影响农户成本效率的因素进行分析。结果表明：合作社成员的技术效率、成本效率、规模效率均高于非合作社成员。对合作社成员来说，苹果分级服务是提高成员成本效率重要方面；对非合作社成员来说，信息成本和运输成本则是影响其成本效率的主要因素。6.在证明以合作社为经营主体的合作交易制度，是有利于提高中国小规模农户组织化的基本制度安排的基础上，建立有序Logit模型，对影响合作交易制度持续发展的因素进行探讨。结果表明：合作社成员的种植面积、合作社的价格服务功能、运营规模，以及社员对合作社发展潜力评估，对合作社成员的投资意愿有显著影响。需要指出的是，合作社的运营规模越大（主要涉及社员总数、社员总耕地面积、带动周围农户数量、年均农产品销售量等），并不意味着社员对合作社投资意愿也越大。社员对合作社进一步发展的投资意愿主要取决于合作社是否建立有效的治理结构、健全的管理体系，合理的公积金分配机制，以及理事长与社员间、小规模社员与大规模社员间是否有良好的沟通渠道，合作社能否及时、有效的帮助社员解决农业生产销售过程中存在问题。总体上，本文基于交易成本理论，应用规范分析方法，通过深入分析农户合作交易制度的内在机理，概括并建立农户合作交易制度选择的研究体系。较为系统地分析了以农民专业合作社为经营主体的合作交易模式（即农户加入农民专业合作社并与合作社进行农产品交易）对农户（社员）在矫正市场行为和降低交易成本方面的正向影响；应用实证分析方法，检验“以农民专业合作社为经营主体的产前-产中-产后”纵向一体化的合作制度是带动弱势群体（即小规模农户）实现规模经济的有效途径。上述研究结论，可为政府支持建立以农民专业合作社为经营主体的产前-产中-产后纵向一体化合作制度，并引导农户选择合作交易制度的公共政策，提供决策支持。