社会中介组织是社会发展日趋多元化的产物，被视为与政府和市场主体并列的第三大社会体系。近年来，我国社会中介组织的数量快速增加，但是其发展受到多重因素的制约，尤其是内部治理中的局限性严重限制了其在提供社会公共服务状况、履行社会责任中的应有的作用和功能。为了更好地了解和分析我国社会中介组织的内部治理现状，本文以江西神州司法鉴定中心为例，对现阶段社会中介组织内部治理机制进行实证分析，探讨了产权制度、发展机制、治理结构、决策程序以及财务管理制度上的局限性。这些局限性造成了这些社会中介组织的管理难题，对社会中介组织的进一步发展壮大形成挑战。因此，完善社会中介组织的内部治理机制势在必行。　　一般而言，治理包括内部治理和外部治理。就外部而言，良好的法治环境、有效的政府监管和外部约束机制构成了社会中介组织的外部治理环境。就内部而言，社会中介组织内部理事会、高级管理人员和监事会对内部职权和职责进行分配，并彼此制衡。社会中介组织内部治理机制的基础在于对社会中介组织性质的再认识，根据科斯定律中关于企业的定义，企业是作为市场的某种替代而存在，社会中介组织具有企业的性质；社会中介组织内部治理机制的关键在于所有权和经营权的分离，即通过明确委托——代理关系理清所有权和经营权的关系；社会中介组织内部治理机制的主体是所有的利益相关者，包括所有者、管理者、执行者、内部职工、服务对象或受益人等，内部治理机制是由各利益相关者组成的一个系统，应该保障所有利益相关者参与协同治理。　　社会中介组织作为一个市场经济中的主体，需要一个有效的制衡、协调的制度结构和外部环境。良好的社会中介组织的外部环境是构建内部治理机制的重要前提，具体而言包括理清社会中介组织和政府的关系，实现其自身的独立性，同时完善法律制度，为构建社会直接组织的内部治理机制创造良好的外部环境。社会中介组织的内部治理机制是指在现代企业制度的基本产权结构下，对组织进行控制和管理的体系，是所有者为保障自身利益而通过规则和机制约束经营者经营行为的过程，是影响组织管理和运行过程的利益相关者基于契约关系而形成的一种制度安排。这种制度安排由组织的所有者、管理者和执行者之间的制衡关系构成，通过通过所有者大会、董事会对组织的管理者、经营者进行任免、监督和评价，并由监事会进行监督来规范社会中介组织的运营和日常管理。社会中介组织的内部运行机制由一系列界定所有者、管理者、执行者和其他利益相关者的行为规则和程序及其运行机制构成。就社会中介组织的内部治理结构而言，由于社会中介组织天然地具有“企业”的性质，因此可以充分借鉴公司化治理结构，通过权力机构、决策和执行机构、监督机构并存的治理形态，形成社会中介组织的权力互动格局。同时，构建多元化的分配机制和完善的财务管理制度，形成科学的内部管理制度。最后，本文引入江西省神州司法鉴定中心的实例展开优化社会中介组织内部治理机制的实证研究。内部治理机制应该建立在明晰的产权结构基础之上，神州司法鉴定中心应建立股东会、董事会和监事会的内部治理结构。股东会作为出资方的代表享有收益和剩余索取权；董事会作为决策和执行机构，负责管理日常工作和开展业务；监事会通过行使内部监督职能保障中心的有序运转。