随着我国市场经济体制的日益完善，各个市场主体之间的竞争变得越来越激烈，产业竞争力特别是主导产业的竞争力成为决定一个国家或地区竞争实力的主要指标之一。医药制造业或称制药行业，是关系到所有社会成员身体健康和生命安全的重要经济部门，也是我国经济增长较快的行业，在国民经济中的作用日益凸显。近年来，随着生物医药行业被确定为上海市六大重点发展行业之一，上海市医药制造业发展迅速，在全球医药市场竞争激烈的大背景下面临更大的挑战和机遇。本文在回顾国内外竞争力和产业竞争力相关理论的基础上，结合金碚教授的比较优势和竞争优势双重理论，首先对我国及上海市医药制造业现状进行简要分析，然后根据比较优势和竞争优势二者的联系和区别，分别建立科学的符合实际的指标体系，运用主成分分析等统计方法，借助SPSS统计软件，分析上海市医药制造业的比较优势和竞争优势，得到上海市医药制造业的行业间和行业内竞争力。最终综合比较优势和竞争优势，并结合SWOT分析，提出提高上海市医药制造业竞争力的建议。