IL20RB基因和UPS系统在肾透明细胞癌中的临床价值分析

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背景:肾透明细胞癌是肾癌最常见的病理类型,是严重威胁人类生命健康的泌尿系统恶性肿瘤。白细胞介素20受体β亚基,简称IL20RB,最初被发现与许多自身免疫性疾病相关,近年来IL20RB在许多肿瘤中的作用也受到越来越多的关注,但是IL20RB在肾透明细胞癌中的临床价值仍不清楚。泛素蛋白酶体系统(UPS)在肿瘤发生发展中扮演重要角色,但UPS系统整体在肾透明细胞癌中的临床价值少有探讨。本文将主要探讨IL20RB基因和UPS系统在肾透明细胞癌中的临床价值。方法:第一部分,我们综合运用各类工具,包括分析软件GSEA、R语言、Perl语言,包括在线分析网站 UALCAN、GEPIA、cBioPortal、MethSurv、Xena、Esurv、TIMER、KM Plotter,包括数据库 TCGA、GEO、Oncomine、CCLE、Expression Atlas、STRING,对IL20RB在肾透明细胞癌中作为生物标志物的临床价值进行全面而深入的分析,采用的分析方法包括差异表达分析、生存分析、表达与患者临床特征的相关性分析、分子遗传学改变分析、甲基化改变分析、功能分析、免疫浸润分析。第二部分,我们下载TCGA中的肾透明细胞癌队列和GEO中的GSE29609队列的患者的原始表达数据和临床资料,进行UPS系统在肾透明细胞癌患者中的临床价值分析,包括差异表达分析、功能分析、生存分析、临床相关性分析等,进一步地,我们基于两种思路通过Cox回归建立了两个具有临床应用价值的预后模型。结果:在肾透明细胞癌中,IL20RB的表达水平显著上调。传统的分子遗传学改变与表达上调之间没有显著相关性,但是低甲基化与表达上调显著相关,高表达和低甲基化都预示着患者更差的预后,并且两者都与临床特征具有显著的相关性。IL20RB似乎与肿瘤中的中性粒细胞存在关联,而且IL20RB在不同的免疫微环境中具有不同的预后区分能力。我们最终筛选出91个差异表达的UPS基因,发现了 391个预后相关的UPS基因,最终建立了两个预后模型,模型具有良好的临床预后预测能力。结论:IL20RB基因在肾透明细胞癌中具有显著的预后价值和作为治疗靶点的潜力,IL20RB是肾透明细胞癌中的新的潜在的生物标志物。UPS相关基因在肾透明细胞癌中具有显著的预后价值,基于UPS基因构建的预后模型是有效的。IL20RB基因和UPS系统在肾透明细胞癌中具有显著的临床价值。
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