线粒体DNA单倍型类群与HBV感染和临床结局相关性研究

来源 :昆明医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zpshwx
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[目的]以慢性HBV感染人群、H]BV自限性感染人群和健康人群为研究对象,获取其线粒体DNA控制区的遗传变异和单倍型类群信息;明确研究组间线粒体DNA变异位点和单倍型类群的分布情况,分析不同人群变异位点和单倍型类群的差异。结合临床数据,探讨候选线粒体DNA突变和单倍型类群与HBV易感性和感染结局的相关性。[方法]我们首先测定了来自云南省第二人民医院肝病内科和体检中心的234例HBV自限性感染人群的外周血的线粒体DNA控制区序列,整合本课题组前期获得的272例慢性HBV感染人群和312例健康人群线粒体DNA控制区序列进行分析。将所获得的数据和修订后的剑桥参考序列(revised Cambridge Refrence Sequence;rCRs)进行比对,我们记录了所有个体线粒体DNA控制区的种系突变信息。根据突变信息,我们参考已发表的世界人群线粒体DNA系统关系发育树,将研究对象的线粒体DNA数据划分到特定的单倍型类群中。通过X2检验,我们对慢性HBV感染人群、HBV自限性感染人群和健康人群线粒体DNA控制区突变和单倍型类群的分布频率进行统计分析。结合临床相关信息,对线粒体DNA单倍型类群的分布频率与临床特征的相关性进行了分析。[结果]1线粒体DNA控制区研究结果:通过对来自云南省第二人民医院肝病内科和体检中心的272例慢性HBV感染者、234例HBV自限性感染者和312例健康对照者外周血线粒体DNA测序,获得818份线粒体DNA控制区全长1124bp测序序列,慢性HBV感染组共计280个多态性位点,HBV自限性感染组共计272个多态性位点,健康对照组共计297个多态性位点;其中慢性HBV感染组与健康对照组重叠多态性位点共计194个,慢性HBV感染组特异位点85个;慢性HBV感染组与HBV自限性感染组重叠多态性位点共计230个,慢性HBV感染组特异性位点50个;HBV自限性感染组和健康对照组重叠多态性位点共计168个,HBV自限性感染组特异性位点104个。通过对818条序列进行了单倍型类群的划分,其中700条序列(慢性HBV感染人群231例,HBV自限性感染人群207例,健康人群262例)划分入14种单倍型类群,分别为M*、M7、M8、C、D、D4、D5、A、R9、F、F1、B、B4、B5。未归入以上14种单倍型类群者共118例(慢性HBV感染人群41例;HBV自限性感染人群27例;健康人群50例)。结合前人的数据进行主成分分析,结果显示我们研究的慢性HBV感染人群、HBV自限性感染人群和健康人群来源一致。2对mtDNA控制区突变位点进行X2检验,慢性HBV感染人群和健康人群突变位点分布的分析显示慢性HBV感染人群携带m.151C>T的突变频率(2.12%)显著低于健康人群(7.37%);慢性HBV感染人群和HBV自限性感染人群的突变位点分布分析显示慢性HBV感染人群携带m.146T>C、m.310C>T、m.310+C、m.523-524AC/del 的突变频率(15.81%,20.22%,70.22%,41.18%)显著高于HBV自限性感染人群(8.54%,11.54%,53.85%,25.64%),慢性HBV感染人群携带m.315+C、m.16274C>T突变频率(5.88%,3.30%)显著低于HBV自限性感染人群(26.92%,7.26%);对HBeAg阳性和HBeAg阴性慢性HBV感染人群的突变位点进行分析显示HBeAg阳性人群携带m.16266C>T的突变频率(9.68%)明显高于HBeAg阴性人群(2.38%)。3 mtDNA单倍群类型分布频率分析,结果显示慢性HBV感染人群携带单倍群类型D5的分布频率(8.09%)明显高于健康人群(3.20%);慢性HBV感染人群携带单倍群类型D5的分布频率(8.09%)明显高于HBV自限性感染人群(3.84%);健康人与HBV自限性感染者、HBeAg阳性与HBeAg阴性慢性HBV感染者中单倍型类群分布无差异。4对携带mtDNA单倍型类群D5和非携带单倍型类群D5的慢性HBV感染人群、HBV自限性感染人群、健康人群、HBeAg阳性和HBeAg阴性慢性HBV感染人群进行一般临床特征分析,结果显示三组研究对象性别、年龄和肝功能指标无差异;5从性别层面上对男女分别进行单倍型类群分布频率的比对,发现各组间单倍型类群分布无差异。[结论]1线粒体DNA多态性位点m.151C>T在健康人群中的频率显著高于慢性HBV感染者,提示该位点变异可能是慢性HBV感染的潜在保护因素,即未携带该突变的健康人群可能对HBV易感;2 多态性位点 m.146T>C、m.310C>T、m.310+C、m.523-524AC/del 在慢性 HBV感染人群中的频率明显高于HBV自限性感染人群,提示该变异位点可能是HBV持续感染的潜在危险因素;慢性HBV感染者携带m.315+C、m.16247C>T突变频率显著低于HBV自限性感染者,提示该变异位点可能与HBV清除相关;3多态性位点m.16266C>T在HBeAg阳性人群的突变频率明显高于HBeAg阴性人群,提示m.16266C>T变异可能与HBV慢性感染结局不同相关。4 mtDNA单倍型类群D5可能是HBV持续感染的危险因素,且与性别、年龄肝功能无关。
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