基于miRNA组学探讨益脉降脂汤改善泡沫细胞脂质代谢调控机制的研究

来源 :广西中医药大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:huayuaneee
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:本研究以泡沫细胞模型为研究对象,用益脉降脂汤含药血清进行干预,观察不同剂量的含药血清对泡沫细胞的脂质含量的影响作用;运用全基因组芯片技术探讨益脉降脂汤含药血清干预泡沫细胞后mi RNA表达谱的影响,并筛选差异mi RNA,通过生物信息学方法对差异基因及差异mi RNA进行靶基因预测,并对预测获得的靶基因进行基因本体学(Gene Ontology,GO)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)进行信号通路分析,筛选出相关的可能的信号通路,从而为益脉降脂汤的临床应用提供科学客观的理论依据。方法:(1)以我院老年病科常用药“益脉降脂口服液”为研究方剂,在血清药理学理论基础上,将SD大鼠30只,每只体重约210±10g,按实验分组随机分成益脉降脂汤中药高、中、低剂量组,及立普妥西药组(阿托伐他汀钙片)、空白对照组,每组6只,灌胃时按益脉降脂汤中药高、中、低剂量组及西药组,分别给予相应浓度益脉降脂汤、阿托伐他汀钙片(立普妥)灌胃,空白对照组予蒸馏水灌胃,均连续灌胃1周后提取各组含药血清。(2)以人源THP-1(人单核细胞白血病)细胞诱导建立的泡沫细胞:将THP-1细胞使用佛波酯(PMA)诱导24h,使其贴壁分化成巨噬细胞,继以氧化低密度脂蛋白(ox-LDL)孵育48h,最后通过油红O染色观察泡沫细胞脂质蓄积情况,建立泡沫细胞模型。(3)将人类单核细胞株THP-1进行培养、传代、冻存以及复苏。实验分组按照巨噬细胞组、模型组、立普妥组(阿托伐他汀组)、及益脉降脂汤含药血清中药大鼠含药血清低剂量组、中剂量组、高剂量组,除巨噬细胞组外,其余各组建立泡沫细胞,使用不同组别的10%大鼠含药血清进行干预,时间梯度设置为12h、24h、48h,采用噻唑蓝法(MTT)检测细胞增殖活性;同时检测各组含药血清干预泡沫细胞后细胞内总胆固醇含量;并在不同剂量组含药血清干预后观察并对比分析各组泡沫细胞红色脂质的蓄积情况。(4)各实验组干预结束后收集上清,收集各组细胞,按照Super Total RNA Extraction Kit试剂盒(Progemega)标准操作流程采用离心柱法提取Total RNA。对各组样本进行质量检测控制及构建文库,文库经过phi29酶的作用下,形成DNA纳米球(DNA Nanoball,DNB),采用阵列式芯片技术将DNBs结合到位点阵列,采用联合探针锚定聚合技术,通过华大基因公司BGISEQ-500测序平台完成small RNA测序。经过高通量测序技术获得的原始数据标准化处理,得到不同组对比下表达的差异基因,并筛选差异mi RNA,通过生物信息学方法对差异基因及差异mi RNA进行靶基因预测,并对预测获得的靶基因进行基因本体学(Gene Ontology,GO)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)进行信号通路分析,筛选出相关的可能信号通路。结果:(1)MTT法检测细胞增殖活性结果显示,不同时间段相比,与12h和24h对比,含药血清干预各组细胞48h后,测得各组细胞OD值最低;各时间段中药高、中、低剂量组相比,中剂量组OD值最高。从三个时间段独立来看,含药血清干预48h后,模型组OD值显著减少,其余各组细胞OD值差异不明显,与模型组对比,立普妥组与益脉降脂组各剂量组的OD值均显著升高(P<0.05),与模型组组相比,益脉降脂高剂量组与低剂量组OD值均显著升高(P<0.05);24h模型组OD值与其余各组相比,显著降低(P<0.05),与立普妥组相比,益脉降脂组低、中、高剂量组OD值降低,差异有统计学意义(P<0.05);与益脉降脂组中剂量相比,低剂量组、高剂量组OD值降低,差异有统计学意义(P<0.05);12h空白对照组组OD值与其余各组相比显著增加(P<0.05),与模型组对比,立普妥组与益脉降脂组低、中、高剂量组OD值显著增加(P<0.05),差异有统计学意义。(2)细胞内总胆固醇含量水平测定结果显示,不同时间段相比,与12h和24h相比,48h后细胞内胆固醇含量最低;同时间段相比,每个时间段中,与空白对照组相比,模型组细胞内TC含量显著增高且差异有显著性(P<0.05);与模型组相比,立普妥组与中药各剂量组细胞内TC含量明显降低,且P<0.05,差异有统计学意义。(3)不同中药剂量组含药血清干预48h,与模型组对比,可减少泡沫细胞的脂质蓄积,Image J半定量分析显示,与模型组对比,立普妥组、益脉降脂汤含药血清低剂量组、中剂量组、高剂量组脂质蓄积均有所改善。(4)经基因测序结果表明:经过中药组干预之后,与模型组对比,筛选出55条显著差异表达mi RNA,其中39条mi RNA上调,16条下mi RNA下调。为排除假阳性差异,进一步缩小筛选范围,依据筛选条件为差异倍数绝对值|log2(MODEL/DRUG)|≥2;Qvalue<0.01;且两组任意一组或两组须满足表达量>1,筛选出7个差异mi RNA,发现它们分别是hsa-mi R-3150a-3p、hsa-mi R-7704、hsa-mi R-877-3p、hsa-mi R-150-5p、hsa-mi R-423-5p、hsa-mi R-374c-3p、hsa-mi R-374b-5p,尤其以hsa-mi R-423-5p、hsa-mi R-374c-3p、hsa-mi R-374b-5p这三个差异mi RNA,表达量丰富,且差异倍数显著;GO分析显示,涉及生物过程(biological process,BP)的主要功能有脂蛋白分解代谢过程、脂质代谢过程、c GMP生物合成过程、c GMP介导的信号转导、葡萄糖代谢过程、环核苷酸生物合成过程、细胞蛋白质代谢过程等;涉及细胞组分(cellular component,CC)的主要功能有参与形成低密度脂蛋白颗粒、中密度脂蛋白颗粒、乳糜微粒、乙酰胆碱门控通道复合体、细胞质膜、胞浆、内质网等;涉及分子功能(molecular function,MF)的主要功能有裂解酶活性、鸟苷酸环化酶活性、磷氧裂解酶活性、c GMP抑制环核苷酸磷酸二酯酶活性、离子通道活性、蛋白质结合、含蛋白质复合物结合、肽受体活性、突触后膜电位调节中的补体结合、磷酸二酯水解酶活性等;KEGG PATHWAY分析显示:93个mi RNA靶基因共同参与了208条显著性通路,其中与可能和脂质代谢密切相关的通路为c GMP-PKG信号通路、c AMP信号通路、脂肪酸降解、胆固醇代谢、胰高血糖素信号途径。结论:(1)THP-1细胞在320nmol/L的佛波酯(PMA)的浓度诱导24h,继以80mg/L的ox-LDL(氧化低密度脂蛋白)的条件下孵育48h,可成功建立泡沫细胞模型。(2)益脉降脂汤含药血清对巨噬细胞泡沫化具有减少胆固醇蓄积的作用。(3)益脉降脂汤调节脂质代谢的作用途径可能受hsa-mi R-3150a-3p、hsa-mi R-7704、hsa-mi R-877-3p、hsa-mi R-150-5p、hsa-mi R-423-5p、hsa-mi R-374c-3p、hsa-mi R-374b-5p等mi RNA调控;其中与可能和脂质代谢密切相关的通路为c GMP-PKG信号通路、c AMP信号通路、脂肪酸降解、胆固醇代谢、胰高血糖素信号途径。
其他文献
在海外市场开拓中,外贸企业一直面临着各类信用风险,而2020年以来,受新冠肺炎疫情和美国等国家逆全球化势头不断增强,外贸企业面临的出口信用问题更加突出显著。而出口信用保险(以下简称信保)作为应对出口信用风险的重要工具,在实际业务中究竟如何发挥作用,企业在使用过程中又究竟存在哪些问题呢?本文以A企业为例,通过分析该公司风险管理的现状,聚焦于该企业使用信保进行信用风险管理的问题,以相关理论为理论基础,
学位
目的:分析单侧入路椎体成形术(PVP)治疗骨质疏松性椎体压缩骨折(OVCF)影响骨水泥弥散效果的危险因素。方法:筛选2020年1月1日-2021年12月31日于本院住院行经椎弓根单侧穿刺经皮椎体成形术治疗的骨质疏松性椎体压缩骨折患者,根据其术后X线影像学资料显示骨水泥在椎体内弥散效果将其分为两组:良好组和非良好组,两组共纳入86例患者,搜集两组对象患者一般情况包括年龄、性别、伤椎形态、骨折至手术时
学位
2020年初因新冠肺炎迅速蔓延开来,武汉市快速建成火神山和雷神山两座医院,两座医院从项目选址到建设施工直至最终交付使用,仅历时十余天,可谓是“神仙速度”,于此同时也让更多的人认识到装配式建筑的优势与效率。装配式建筑与传统施工工艺相比,其具有建筑能耗低、人工成本低、节约资源等优势。众所周知,房地产行业投入资金量大、建设项目的建设周期长,且项目前期开发手续程序复杂,组织结构复杂,跨专业整合性强等特点,
学位
儒家中庸思想其要旨在“执中”“时中”,即在事物的动态变化之中追求“无过无不及”的最佳状态。儒家中和理念将“中”与“和”并提,强调“和而不同”“和为贵”,实为中庸哲学“用中”所达到的理想境界。先秦儒家的中庸中和思想在哲学思维层面深刻影响了《黄帝内经》基础理论的构建。《黄帝内经》不仅视人体与自然环境、社会环境为一中和整体,更视人体为一以五脏为中心多系统多因素相互关联影响的中和整体。其中任一因素的失“中
期刊
针对机械臂路径规划方法存在的规划效率低、连杆通过性差、路径粗糙等问题,以渐进最优快速随机搜索树RRT*为基础,提出一种位姿约束下的双向扩展机械臂路径规划方法(PCO-BT-RRT*)。首先,设计目标偏置引导的双向扩展RRT*算法(BT-RRT*),改进了RRT*算法的初始化过程,将起始点和目标点分别作为两棵随机树的初始节点,并通过目标偏置策略引导其以一定概率相向生长,加快探索未知区域,在保证路径代
期刊
目的:采用整脊手法结合静力性抗阻训练干预对神经根型颈椎病患者康复作用分析,探究该法在神经根型颈椎病防治康复的优势,为防治神经根型颈椎病提供一个有效的、适合推广应用的非药物中医康复疗法。方法:选择2021年3月至2022年3月期间在广西中医药大学第一附属医院康复科门诊、康复科住院的神经根型颈椎病患者作为研究对象,样本共60例。随机将其分为2组,治疗组采用手法联合静力性抗阻训练,对照组采用手法联合颈椎
学位
报纸
中国农业发展银行在国家支农政策实施中扮演着举足轻重的角色。A农发行作为直属国务院领导的一家国有农业政策行,由于其信贷投向弱质性的农业,其信贷业务暴露出了大量的风险隐患。论文通过对其信贷风险的科学评估与管理,达到化解其信贷风险的目的。针对A农发行信贷风险的管理现状,通过风险识别找出A农发行信贷风险点,构建信用评级模型对其信贷风险水平进行合理评估,采用风险控制化解贷款风险。根据评估结果对A农发行信贷风
学位
目的:基于精子发生微环境探讨加味大黄蟅虫颗粒对精索静脉曲张(varicocele,VC)模型大鼠生精细胞凋亡的调控,评价加味大黄蟅虫颗粒对VC模型大鼠睾丸生精功能的保护作用。方法:选取40只清洁级青春期雄性SD大鼠,按随机数字表法分成假手术组、模型组、迈之灵组及加味大黄蟅虫颗粒组,每组10只。参照Turner部分左肾静脉缩窄术建立VC大鼠模型。造模完成后,假手术组及模型对照组大鼠均给予生理盐水,迈
学位
从现代建筑企业的角度来讲,评价一个企业核心竞争优势强弱的核心评价指标就在于人力资源管理能力,同时其也是支撑企业在日益严峻的行业竞争形势下脱颖而出的有力支撑。国有建筑企业作为推动我国基建事业的中坚核心力量,加强国有建筑企业人力资源管理,解决国有建筑企业员工流失问题对国有建筑企业的可持续发展有着关键的作用。基于工作条件便利,本文利用案例分析、问卷访谈及企业实地调研等综合研究方法,选择Z公司这一国有建筑
学位