作为拥有14亿人口的国家,我国始终将保障全民健康的追求放在战略层面。随着卫生投入的不断增加以及医药体制改革的不断深化,全民医保制度基本建立,基本公共卫生服务质量大幅提高。但由于我国的卫生专项资金在下拨分配过程中需要经过层层审批,不仅周期长,牵涉范围也广,加之管理制度还不健全,容易导致资金下拨不及时、分配不合理、管理不规范等问题。由于卫生专项资金直接关系到人民的民生利益,开展专项审计,对卫生专项资金实施监管的重要性日益突出。审计全覆盖作为新的审计理念,主要有四个方面的内容:审计对象全覆盖、审计内容有重点、审计资源共监督以及审计手段数据化,借助大量的数据客观公正地揭露问题及漏洞,严厉惩处违纪违规行为,这对于审计机关履行监督职责、发挥监督作用具有高度指导意义。将审计全覆盖要求应用于卫生专项审计中,能够有效扩大审计面,保证审计工作的广度与深度,有助于减少违规行为,保障资金运行规范和使用效益。不仅审计不留死角,严肃问责的要求更使卫生专项资金问题的整改率提高,减少资金浪费。本文第一部分通过大量文献研究梳理了研究背景及意义,并对卫生专项资金的审计目标、审计原则、审计程序进行阐述,介绍了相关理论。第二部分则结合调研情况和资料搜集对A市卫生专项资金审计情况进行系统性描述,主要包括医保基金经济活动和基层医疗卫生建设两个方面。第三部分则是根据A市的专项审计具体过程和审计情况分析,发现四个方面的审计问题:审计流程不规范、审计管理方法单一、信息获取不全面以及意见整改与监督不到位。然后根据审计全覆盖四个内容为切入点,剖析审计问题背后的原因:专业能力不足、组织模式不科学、信息化建设不充分、协调配合机制不健全。第四部分根据审计问题的原因,并将组织学习理论、公众参与理论分别引入到审计质量层面和审计监督层面,相对应地提出四个方面的建议:提升专业素养、创新组织模式、强化大数据关联分析、建立多部门联动机制,实现审计事项、审计管理、审计内容和审计结果全覆盖。