本试验以多种组培和野生金线莲样品作为供试材料，通过ISSR分子标记方法对供试材料进行遗传背景、亲缘关系的研究；并利用RT-HPLC法对金线莲的化学成分建立金线莲HPLC指纹图谱；同时测定金线莲中3种有效成分含量，并对影响组培金线莲和盆栽金线莲的3种有效成分的多个因素进行了研究。研究结果如下：1建立并优化了金线莲ISSR分子标记体系。筛选出了多态性较好的12条引物，共扩增出117个ISSR条带，多态性比率达到94%。通过不同的遗传距离对遗传图谱中的供试材料进行聚类。聚类结果表明：金线莲的亲缘关系(基因)在一定程度上与其形态学特征和地缘关系相一致。2获得了分离度较好，具有12个共有峰，8号峰为槲皮素的金线莲HPLC指纹图谱。通过中药色谱指纹图谱相似度分析，得到其中15份金线莲材料与对照的相似度较高。相似度为0.911~0.966。3金线莲的多糖含量变化范围为7.50%~19.31%；总黄酮含量变化范围为0.429%~1.434%；游离氨基酸含量变化范围为1.91%~7.92%。组培金线莲中多糖和游离氨基酸含量相对较高。野生金线莲中总黄酮含量相对较高。4供试材料、生长周期和培养基中6-BA含量对组培金线莲3种有效成分的含量均产生显著影响，且3个因素内不同水平间差异极显著。影响组培金线莲3种有效成分含量的3个因素中生长周期的作用最为显著，培养基中6-BA含量的影响作用相对较小。5盆栽金线莲中，银色叶脉金线莲其总黄酮和游离氨基酸含量相对较高，金色叶脉金线莲多糖含量相对较高。影响盆栽金线莲3种有效成分的含量的3个因素由主到次依次是：叶脉颜色、盆栽生长周期和株高。