基于碳纳米材料的致病菌快速检测方法研究

来源 :湖南师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:renjie1986
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近些年来,由于碳纳米材料具有各种优良的特点,例如:出色的生物相容性以及稳定性,低合成成本与毒性等,被广泛的应用于各种生物领域。其主要形态包括碳纳米管,石墨烯,纳米碳颗粒等。按照荧光性区分又能分为有荧光性的纳米碳颗粒一类与有猝灭特性的碳纳米管石墨烯一类。本文以碳点为材料,合成出分子信标。该信标包含碳点(CNPs)、猝灭基团(BHQ1)以及特异性核苷酸序列。利用该分子信标,分别以肠炎沙门氏菌的16S rRNA以及甲型副伤寒沙门氏菌菌体为靶标,设计了两种利用碳纳米颗粒为荧光染料的检测体系,分别对这两种沙门氏菌进行了快速检测。主要包括以下两方面工作:1.检测肠炎沙门氏菌的16S rRNA.核糖体是一类广泛被用做检测靶标的物质,它能够和特异性的核昔酸探针进行结合。比起传统方法,利用核糖体作为靶标设计探针要更加简便与快捷。这一部分阐述了一种基于荧光能量共振转移,利用肠炎沙门氏菌16S rRNA的V3-V6区域特异序列为靶标的检测方法。在该体系中,单壁碳纳米管(SWNTs)对固定在上面的设计探针具有吸附性,两者之间以π-π键相结合。当反应溶液中存在有靶标的时候,由于探针与靶标之间的稳定性大于探针与碳纳米管之间的稳定性,因此探针被从碳纳米管上拉离下来,并将分子信标的结合位点暴露出来。随后,分子信标与探针结合,形成的双链结构被切刻酶特异性识别、切断。切断后的分子信标由于太短以至不能够再维持原有形态,最终从探针上脱落下来。此时能量共振转移现象消失,碳点发出荧光。而加入其他细菌的16S rRNA时,荧光信号不会被检测到。结果证明,该方法对检测16S rRNA的V3-V6区域特异序列有很高的灵敏性与特异性。其检测下限在超纯水中达到了100CFU/ml,在牛奶样品中达到了150CFU/ml.在102-3×103CFU/mL(水中)以及1.5×102-3×103CFU/mL(牛奶)的浓度范围内存在线性关系。实验结果显示这种基于FRET的检测方法能够被用来检测致病菌,并加以广泛应用。2.利用适配体设计探针检测甲型副伤寒沙门氏菌。该方法利用荧光能量共振转移和核酸外切酶的识别特异性对甲型副伤寒沙门氏菌进行检测。在该检测体系中,分子信标上的碳点由于荧光能量共振转移现象,在490nm的激发波长下并不发出荧光。DNA探针包含三个部分:5’端的多余部分,中间的适配体部分,3’端的多余部分。当反应溶液中加入甲型副伤寒沙门氏菌后,DNA探针上的适配体部分能够与细菌结合,而两端余留的核苷酸片段则不会,最终探针和细菌形成了一个Ω型结构。此时分子信标同探针两端多余的部分互补配对,形成双链结构,并被核酸外切酶识别,最终分子信标被切断,在490nnm的激发波长下发出荧光信号。在牛奶样品中,其检测下限为250CFU/mL.实验结果表明,利用此方法能够快速准确地检测甲型副伤寒沙门氏菌。
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