【摘 要】
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目的:利用转录组数据,探究多发性骨髓瘤(MM)中氧化磷酸化(OXPHOS)的变化及筛选影响MM患者生存预后的OXPHOS代谢相关基因,构建多基因模型并生成OXPHOS风险特征,分析其临床意义。方法:通过差异表达基因(DEG)分析和加权基因共表达网络分析(WGCNA)获得MM相关的基因和模块,富集分析探究其生物学功能。使用单因素Cox、LASSO和多因素Cox回归分析筛选与MM患者总体生存期(OS)
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目的:利用转录组数据,探究多发性骨髓瘤(MM)中氧化磷酸化(OXPHOS)的变化及筛选影响MM患者生存预后的OXPHOS代谢相关基因,构建多基因模型并生成OXPHOS风险特征,分析其临床意义。方法:通过差异表达基因(DEG)分析和加权基因共表达网络分析(WGCNA)获得MM相关的基因和模块,富集分析探究其生物学功能。使用单因素Cox、LASSO和多因素Cox回归分析筛选与MM患者总体生存期(OS)相关的OXPHOS代谢基因并构建最优预后预测模型。利用多基因预测模型的回归系数与模型基因表达值计算得到每个患者的风险得分,以风险得分的中位数为截点将患者分为低风险和高风险两组。通过Kaplan-Meier生存分析和log-rank检验比较两组患者生存率,绘制时间依赖性受试者工作曲线(ROC)并计算曲线下面积(AUC),评估风险得分的预测准确性。使用单因素和多因素Cox回归分析评估风险得分的独立性。风险得分与MM经典不良预后因素联合构建列线图模型并进行决策曲线分析(DCA),探究整合预测模型的效能及其在MM患者临床决策中的参考意义。最后,分析模型基因的表达和互作关系,并通过实时荧光定量多聚酶链反应(RT-q PCR)验证模型基因在人MM细胞系(HMCL)中的相对表达量。结果:DEG和3个MM相关的模块富集分析结果显示OXPHOS相关通路或功能在MM患者中显著富集。多步骤变量筛选及Cox回归分析后得到一个由9个基因构成的OXPHOS代谢相关风险模型,对应的风险得分可将MM患者分为具有显著不同预后的两组患者,高风险组患者OS和无事件生存期显著低于低风险组(均为P<0.0001)。3年和5年OS的ROC曲线AUC分别为0.728和0.739,提示风险得分具有中等预测能力。两个外部测试集生存分析结果与训练集类似。Cox分析提示风险得分是一个独立危险因素。比较分析显示伴不良预后特征的患者通常具有更高水平的风险得分。列线图模型可有效的预测MM患者的OS,DCA结果显示纳入风险得分的预测模型较单纯的经典不良预后参数模型临床获益在较大OS阈值内显著提高。RT-q PCR结果显示6个危险基因在人MM细胞系中表达上调,与数据集分析结果基本一致。结论:OXPHOS代谢在MM中显著富集,OXPHOS风险特征可有效区分具有不同预后结局的患者,提高MM经典不良预后参数的预测能力和临床获益,可能有助于MM危险分层和治疗指导。危险基因在MM中表达显著上调,与MM患者不良预后相关,可能是MM潜在的治疗靶点,值得进一步深入研究。
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