辽河流域是我国的七大河流之一,是东北地区的社会中心、经济中心、以及活动中心。近年来由于人类活动的过渡干扰,辽河水质恶化严重,河流生态系统也面临着严重退化,是我国重点进行治理的“三河三湖”之一。由于传统的水环境管理方式只能解决水质层面上的水环境问题,无法全面反映生态系统所承载的全部环境压力。因此,为了保证尽早遏制生态系统的退化,保持生态功能和服务功能的正常运行,就必须识别出流域内不同河流,不同尺度生态系统的特征、结构与功能,运用流域水生态分区的方式,将流域按等级和功能划分,因地制宜的缓解和改善现有的生态环境问题。本文试以辽河保护区为研究对象,在现有的辽河流域水生态功能一、二级分区的基础上,继续研究流域水生态三级分区的理论体系,试从中观尺度上,即河段尺度上反映生态系统的空间异质性。根据2012年参与的对辽河保护区内的24个点位的鱼类信息调查,并与历年的资料及数据对比,显示辽河保护区内,鱼类群落数量已明显减少,而且群落结构趋于单一化,个别点位出现严重的生态破坏,鱼类资源极度低下；根据流域水生态功能分区的尺度需要,在辽河保护区内以河流类型、河流生境尺度进行流域水生态三级区划分,并分析、总结各区域水生态系统的特点,为水环境管理提供了科学的数据支持和理论基础。