冷季型香菇(Lentinula edodes)菌种的分子鉴定

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本研究选用了32个应用广泛的冷季型香菇栽培品种和2个野生香菇菌种,应用ITS区序列差异比较、RAPD技术、ISSR分子标记和培养性状比较分析了它们之间的遗传相关性,结果表明: 1.通过对ITS区的序列分析表明,所有栽培香菇菌株序列同源性为98.49%,其中868、沪农3、秦19和香66,以及野11、庆科20、867和241-4之间有完全相同的序列。是否这些菌种是同物异名有待进一步证实。相反的,华939、939与L939有相似的名称,但ITS区序列存在5个碱基的差异。将所有栽培菌株的ITS区序列结合从GenBank中查寻的国外的野生菌株的ITS区序列进行系统分析,结果发现野生香菇菌株与栽培香菇菌株分属于两个分枝,说明栽培菌株与野生菌株间有遗传差异,栽培菌株间存在极大的遗传相似性,而且菌种问的遗传关系与地域没有联系。这进一步暗示32个栽培菌株的遗传多样性低。 2.从86个RAPD随机引物中筛选出9个引物对供试菌株的基因组DNA进行分析,共扩增出113条带,其中94条带具有多态性,多态性带的比率达83.19%。单个引物扩增的DNA片段的平均数目在13,片段的分子量大小在200~2500bp之间。如用引物A04扩增菌株868获得7条带,其片段大小在400~2300bp之间。综合分析9个具有多态性的DNA指纹图谱,被测试的34个香菇菌种之间均有遗传上的差异,能将所有菌株区分开来,从而证实了RAPD技术可以快速、灵敏、准确地用于食用菌菌种的检测和鉴定。从遗传相似系数及聚类结果表明,野生子实体与栽培品种之间存在明显的遗传差异;而多数栽培菌种聚在一起,遗传相似系数主要集中在0.50~0.70之间,说明香菇栽培菌种间的遗传背景十分单一。菌株华939、939和L939聚在一起,说明亲缘关系相近,可能是同物异名。 3.从100个ISSR引物中筛选出8个对供试菌株具有多态性的引物进行扩增,共产生98条DNA带,89.80%呈现多态性。如引物812扩增所有菌株共获得13条带。聚类分析结果显示,34个香菇菌株间均有遗传上的差异,但遗传相关性极高。同时表明ISSR扩增指纹能有效分辨不同菌株的基因型,为香菇栽培菌株的鉴定提供快速有效的技术手段和科学依据。菌株华939、939和L939聚在一起,说明亲缘关系相近,可能是同物异名。这与RAPD结果一致。 4.通过菌株栽培性状比较试验,发现32个菌株在菌丝生长速率、菌丝长势、菌落形态和出现原基的时间等方面有一定的差异。如平板试验中,菌株Cr20生长缓慢,而香26生长快。其中在平板试验和瓶栽试验中,菌丝生长速率趋于一致,即在平板试验
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