自从2001年国务院成立行政审批制度改革领导小组以来，从中央到地方进行了多次全面而深入的改革，并取得了一定的成果。但是由于改革未能触及我国部门横向分割的许可权配置，使得审批领域多头审批、重复审批、审批程序不规范等问题依然突出，为公民提供的依然是部门式、碎片化的审批服务，这不仅不能满足广大民众对政府提供整合性服务的诉求，更严重阻碍了我国市场经济的深入发展。因此，基于整体政府的理念来探讨我国行政审批制度的整体性改革具有重要的现实意义。该文首先对整体政府理论进行了概述，指出整体政府是全面深化行政审批制度改革的理论基础。其次，从我国行政审批制度改革的现状出发，主要是分析了行政审批制度改革中存在的问题及其原因。再次，介绍了美国、日本行政审批制度改革的历程及其主要做法，指出美日经验对我国行政审批制度改革的启示。最后，基于以上各方面的分析指出我国行政审批制度整体性改革的设想，主要包括：切实转变政府职能，合理界定政府的事权范围；继续推进大部制改革，整合职能相近的部门；以行政服务中心为依托，实行线上与线下联合审批；大力发展行业协会和中介机构；建立完善的行政审批监督机制。我国行政审批制度改革进行了多年，一直未能取得突破性进展。而近年来，学者们基于整体政府理论来研究行政审批制度改革为我们提供了一种新思路。于是本文在相关学者的研究基础上，采用规范研究与实证研究相结合的方法，从建立大部制、转变政府职能、制定行业联合审批标准等方面提出了行政审批制度整体性改革的设想。