事业单位绩效工资改革作为收入分配制度改革的核心部分，自2009年9月2日国务院常务会议确定了三步走的“路线图”和时间表后，按照“分类指导、分步实施、因地制宜、稳慎推进”的原则正在有序推进。前两步义务教育学校、公共卫生与基层卫生事业单位绩效工资已基本推进到位，作为第三步的重点，科研事业单位的绩效工资改革自2010年1月1日启动以来，尚未形成具体的实施办法。科研事业单位作为国家科技创新体系的主体，推进绩效工资改革，对调动广大科研人员的积极性，激励广大科研人员优质高效的从事科研工作，广出科研成果，推动社会经济发展和科技进步，实现我国有中国特色的社会主义现代化建设宏伟目标都具有十分重要的意义。在国家尚未出台科研事业单位绩效工资改革实施办法的前提下，在国家事业单位绩效工资改革宏观目标的指导下，针对科研事业单位绩效工资管理体系的研究现状，以W研究所为例，分析了现行绩效工资管理体系存在的问题，通过文献研究、案例分析、实地调查等方式，运用激励理论、绩效评价理论、薪酬设计理论等相关理论，提出了改进措施，重新构建了W绩效工资管理体系。本文共分6章。第1章是绪论。主要介绍了论文研究背景、研究目的和意义，回顾了国内外研究现状，简述了论文的框架和研究方法。第2章阐释了绩效工资、薪酬设计的相关理论。第3章至第5章是本文的主体。第3章概述了W研究所单位性质、职责、定位和组织结构、人员结构等环境背景；描述了W研究所绩效工资管理体系现状。第4章结合相关人员绩效工资数据，分析了W研究所现行绩效工资管理体系存在的问题。第5章针对存在的问题，重建了W研究所绩效工资管理体系。第6章为结论。