Ⅰ型鸭病毒性肝炎是由Ⅰ型鸭病毒性肝炎病毒( duck hepatitis virus serotype I, DHV-I)引起的雏鸭的一种急性高度致死性传染病,主要侵害3周龄以内的雏鸭,特别是不足1周龄的雏鸭最易感染,死亡率可达90%以上,是危害养鸭业最为严重的传染病之一。1945年在美国首次发现该病,我国于1963年在上海首次报道了该病的临床病例,并于1980年首次分离到病毒。至今,全国各养鸭地区均有不同程度的发生和流行。因此,对该病及病原进行研究具有重要的意义。本试验以实验室保存的I型鸭病毒性肝炎病毒福建地区分离毒株为研究材料,开展病毒全基因序列的克隆测序、序列分析、生物学特性预测等几个方面的研究。1.根据GenBank中Ⅰ型鸭病毒性肝炎病毒的基因序列,设计合成了8对特异性引物,以实验室分离鉴定并保存的两株福州地区分离的Ⅰ型鸭病毒性肝炎病毒VFY株和NFY株的核酸为模板进行RT-PCR扩增,得到预期大小的目的片段,对其进行剪切和拼接,进而得到完整的病毒基因组序列。2.对DHV-I全基因序列开放阅读框(ORF)编码的多聚蛋白的功能性位点、二级结构进行了预测和分析。对功能性位点的预测结果表明,该多聚蛋白多肽链上有11个N-糖基化位点、26个蛋白激酶C磷酸化位点、38个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、32个N-酰基化位点、4个依赖cAMP和cGMP的蛋白激酶磷酸化位点及2个酪氨酸激酶磷酸化位点。二级结构预测表明,该多聚蛋白多肽链含27.70%的α螺旋结构,23.39%的β折叠结构,48.91%的Loop或其他结构;含有两个跨膜区域,分别位于第1066-1083位和1556-1573位。3.对DHV-I基因测序结果分析表明:DHV-I VFY和NFY两株病毒基因的核苷酸序列与GDZJ株、03D株、A66株、JX株、C80株的相似性分别为97.6%/97.7%、96.9%/97.0%、95.4%/95.4%、95.3%/95.4%、95.4%/95.5%;氨基酸相似性分别为98.4%/98.4%、98.2%/98.2%、97.5% /97.5%、97.5%/97.5%、97.6%/97.6%。VFY和NFY两株病毒基因的核苷酸序列与氨基酸序列的相似性分别为99.5%和98.9%。基因进化树分析可知VFY和NFY株处于同一分支,亲缘关系最近;VFY株及NFY株与GDZJ株、03D株、C80株、A66株、JX株亲缘关系较近,处于同一小分支内。DHV-IVFY株和NFY株与国内的DHV-I各毒株基因的核苷酸和氨基酸的同源性都比较高,具有不同程度的亲缘关系。但与台湾和韩国等地近期分离到的DHV-I新型毒株处于不同的分支,核苷酸和氨基酸的同源性都较低。因此认为此两株病毒应归类于传统的DHV-I。