任何改革都有其两面性，国务院机构改革也不例外。从积极的方面看，机构改革基本完成了其预定目标和任务，使国务院的机构设置和业务职能更加协调，国家行政机构整体朝着健康高效的方向发展。从消极的方面看，国务院机构改革不可能面面俱到，改革中撤销和改组的一些机构，由于国家没有及时制定相应的改革方案，且其自身没有做好迎接改革的充分准备，正面临着非常尴尬和艰难的处境。　　在国务院机构改革后，一些撤销部委的档案馆也同样身处困境:它们面临市场经济的机遇和挑战，面临“身份不明”的尴尬处境，面临“资金短缺”的艰难现状等诸多从未有过的难题。机械工业档案馆作为撤销部委档案馆中的一个典型代表，在改革中经历了两次更名，其工作目标和经营观念发生重大转变，事业单位性质和企业运作理念在内部形成矛盾冲突，它所面临的问题层出不穷。　　分析这些问题的成因并且从理论上提出相应的解决办法便是本文最主要的写作目的。从主观方面，档案馆继续申请事业法人证书，确立事业单位性质;完成国家的上缴任务的同时妥善保管其他档案资源;转变观念主动迎接市场经济带来的挑战，抓住机遇开辟多种经营渠道。从客观方面，国家应该继续推进事业单位改革的进程，对在政府和企业改革中发生变革的事业单位给予充分的重视，并制定相应的法律、法规及章程制度予以保障。