通过菌株的耐碱性筛选，得到了一株能够耐受pHll.5的根瘤菌。经过16SrDNA部分序列、G+C mol％、DNA-DNA杂交的测定，鉴定其为苜蓿中华根瘤菌(S.meliloti)，其编号为CCBAu81024。 采用cDNA-AFLP技术，揭示了苜蓿中华根瘤菌CCBAu 81024在中性与碱性培养时基因表达的差异，并得到了总共8个差异表达的基因片段。其中2个基因片段为碱性表达时下调，6个基因片段为碱性表达时上调。TDFl定位于未知功能的基因SMb21696的编码框内；TDF2定位于基因fdxB与orf10.5编码框之间的非编码区，其功能和调控模式还需要进一步验证；TDF4定位于基因tfxG编码框内；TDF5一部分定位于基因SMc00062编码框中，另一部分定位于基因SMc00062上游；TDF6一部分定位于基因SMb20484的上游，一部分位于SMb20484编码区中，基因SMb20484与小分子物质的转运有关：TDF7一部分定位于基因y4qJ编码区中，另一部分定位于基因y4qK的编码区中；TDF8与疮疱丙酸杆菌的氨酰tRNA合成酶基因同源性达到98％。此外，对tfxG基因进行了较详细的研究。Southern杂交验证了tfxG基因在苜蓿中华根瘤菌CCBAU 81024是单拷贝存在的；Northern杂交证明了tfxG基因在中性培养时为低水平表达，碱性培养时上调表达，表达量约为中性时表达的50-100倍；利用同源重组进行tfxG基因的敲除，得到了tfxG基因缺失突变株，耐碱性实验表明缺失突变株耐碱性能下降，由野生型的pHll.5降低为突变株的pHl0.5；tfxG基因互补试验可以再次恢复突变株的耐碱性能。说明tfxG基因在菌株耐碱的过程中行使了某种功能。但行使何种功能还需要进一步的实验。 另外，初步探讨了tRNA在耐碱调控过程中的作用。也证明了LMwRNA这一技术不仅可以作为分类学上的一种遗传学方法，也可用米研究不同条件下tRNA是否发生改变等。tRNA图谱在pH7、8、9、10以及pH8碱激时的图谱类型基本上是一致的。pH9、10碱激处理的tRNA图谱类型基本一致，但是与pH7时的图谱类型具有较大的差异，差异条带主要位于tRNA class2区域。并且几次重复实验都得到了相同的图谱类型，说明碱激时确实存在着tRNA组分或丰度的改变，也就是说tRNA在耐碱调控过程中起着某种重要的作用。