近年来，随着社会经济的不断发展，大量氮磷等污染物排入河流、湖泊生态系统，造成部分区域湖泊、水库出现了严重的富营养化问题，水质恶化、生物多样性降低，威胁人民健康安全和水生态系统功能退化，成为制约区域社会经济发展的主要因素之一。传统上认为工业等点源污染是造成水体污染主要原因，但自从二十世纪八十年代以来，中央与地方财政投入巨资建设污水处理厂及配套工程，使工业、生活点源污染得到有效控制，但湖泊、水库富营养化状况恶化趋势尚未得到有效控制，主要因素就是流域面源污染尚未得到有效控制。此外，大量研究结果也证实，面源污染是导致长江中下游、云贵高原等区域湖泊、水库水环境恶化的主要驱动因素。由于面源污染具有排放时间不确定、排放途径不确定、排放数量不确定等特点，具有涉及范围广、控制难度大等特征，加强流域尺度上的面源污染研究控制，成为我国目前水环境污染治理的重点和难点问题。本论文针对我国面源污染主要类型（农村生活污水、农田化肥流失、畜禽养殖流失、水土流失、城镇地表径流），通过对流域内五大污染源的研究，提出以水功能区控制单元为基本单元的流域尺度上的面源污染负荷估算体系，并按照水功能区达标要求，形成水功能区控制单元的面源污染控制方案。以颍河流域为研究对象,经过系统的对流域内水质评价成果，分析水质变化趋势，并同时分析流域内各个行政区的五类污染源贡献特征以及各个行政区的四项污染指标（COD、总磷、总氮、氨氮）的空间负荷特征，在分析流域内各个行政区的五类污染源的四项指标空间分布特征的基础上结合水功能区控制单元划分，估算流域面源污染年负荷量及污染负荷空间分布特征，以确保流域水功能区达标为目标，提出流域面源治理控制措施。