【摘 要】
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茶树具有药用、经济价值的木本植物,其自交不亲和性为茶树研究带来了诸多不便,本研究对紫芽茶的芽、嫩叶(紫色)、成熟叶(绿色)进行转录组分析和蛋白质组学分析,对紫芽茶内部代谢进行差异分析,进而为茶树分子育种及提升茶叶品质提供可参考文献,主要研究结果如下:1.通过转录组分析,共获得74465个基因,45455个基因被注释,29010个基因没有被注释,通过与NR,COG/KOG,KEGG,GO,Swiss
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茶树具有药用、经济价值的木本植物,其自交不亲和性为茶树研究带来了诸多不便,本研究对紫芽茶的芽、嫩叶(紫色)、成熟叶(绿色)进行转录组分析和蛋白质组学分析,对紫芽茶内部代谢进行差异分析,进而为茶树分子育种及提升茶叶品质提供可参考文献,主要研究结果如下:1.通过转录组分析,共获得74465个基因,45455个基因被注释,29010个基因没有被注释,通过与NR,COG/KOG,KEGG,GO,SwissProt数据库比对分析,45361个基因被注释到Nr数据库中,27242个基因被注释到COG/KOG数据库中,12171个基因被注释到KEGG代谢途径中,31161个基因被注释到GO数据库,31171个基因被注释到SwissProt。2.通过蛋白质组学分析,鉴定出4549个蛋白,GO数据库对蛋白进行分析,分为生物进程、细胞组分和分子功能三大类,生物过程包括18个子类,其中代谢进程含有3107个蛋白,是生物进程中最大的子类,细胞组分包括14个子类,其中细胞和细胞部分都含有2609个蛋白,是细胞组分中最大的子类,分子功能包括12个子类,催化活性含有2728个蛋白,是分子功能中最大的子类。通过KEGG富集将1626个蛋白富集在120个代谢通路,其中碳代谢(ko01200)含有170个蛋白,占总蛋白数的10.46%,是最大的代谢途径,氨基酸合成途径(ko01230)含有153个蛋白,占总蛋白数的9.41%,是第二大代谢通路。3.芽与紫叶相比,共找到11011个显著差异基因,其中4810个基因上调表达,6201个基因下调表达,822个差异蛋白,其中394个上调,428个下调;紫叶与绿叶相比,共找到27528个显著差异基因,其中4805个基因上调表达,22723个基因下调表达,1033个差异蛋白,其中504个上调,529个下调;芽与绿叶相比,共找到32737个显著差异基因,其中6782个基因上调表达,25955个基因下调表达,1153个差异蛋白,其中563个上调,590个下调。4.对差异基因和差异蛋白的注释功能进行GO富集分析发现:芽与紫叶相比,生物过程上富集于代谢进程、细胞过程,细胞组分上富集于细胞、细胞器,分子功能上富集于催化活性、物质结合;紫叶与绿叶相比,生物过程上富集于代谢进程、细胞过程,细胞组分上富集于细胞、细胞部分、细胞器,分子功能上富集于催化活性、物质结合;芽与紫叶相比,生物过程上富集于代谢过程、细胞过程、单一生物体过程,细胞组分上富集于细胞、细胞部分、细胞器,分子功能上富集于催化活性、物质结合,表明三组样品之间的GO富集较为相似。5.差异基因和蛋白的注释功能进行KEGG富集分析发现:在芽VS紫叶中,光合作用-光敏蛋白、苯丙烷类生物合成、苯丙氨酸代谢、类黄酮生物合成、黄酮和黄酮醇生物合成途径富集程度较高;在紫叶VS绿叶中,类倍半萜烯生物合成富集程度最高,苯丙烷类生物合成、苯丙氨酸代谢、类黄酮生物合成途径富集程度大于0.5,在芽VS绿叶中,类倍半萜烯生物合成途径富集因子大于0.8,苯丙烷类生物合成、苯丙氨酸代谢、类黄酮生物合成途径富集因子都在0.6以上,说明三组比较差异基因富集在苯丙烷类生物合成、苯丙氨酸代谢、类黄酮生物合成途径表达显著。6.进行转录组和蛋白质组学进行关联分析,芽VS绿叶的相关系数是0.718,芽VS紫叶的相关系数是0.6313,紫叶VS绿叶的相关系数是0.5376,芽与绿叶的相关程度较高。
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