随着科研创新活动综合性和复杂性的提高，单一主体很难掌握全部的创新资源，为了弥补资源差异，实现创新资源的优化配置及优势互补，科研创新合作成为科学研究发展的必然趋势。由于地理位置差异等原因，不同区域对创新资源的掌握程度有所差异，区域间创新合作对分摊创新成本、推动资源流通、提高成果质量具有重要作用。粤港澳大湾区作为我国科技创新发展的高地，对国家乃至全球的科技发展和经济发展起着至关重要的作用，对其创新合作进行研究是有意义的。大多数重大科学发现的研究成果都优先在期刊上发表，科技论文作为科研创新的重要成果，是衡量国家、区域及科研主体基础科研能力的关键指标之一，基于论文进行研究能在一定程度上表示科研方面的创新。
　　本研究选取Web of Science数据库中2005-2019年粤港澳大湾区的科研论文数据，对数据进行字段提取及清洗处理，结合大湾区的经济基础和科研基础统计大湾区科研产出及合作的总体情况。在基本统计分析的基础上，运用社会网络分析法构建大湾区在区域内部、国际及国内三个不同空间尺度下的科研合作网络，通过网络密度、凝聚力、中心势、中心度等指标探究多尺度科研合作网络结构的演化特征及趋势，并结合学科领域分布及变化情况对多尺度科研合作进行研究。
　　研究发现，大湾区科研创新发展不断完善，科研创新合作强度逐渐增强，近年来科研合作总量增速较快且对区域外科研资源的重视程度提高。各空间尺度合作网络的规模逐渐扩大，大湾区与越来越多的国家和城市存在科研合作关系，合作网络的凝聚力提高。区域内部层面，广州、深圳等核心城市对网络资源的控制作用逐渐减小，各城市对其依赖度降低;区域外部层面，合作网络核心区成员占比不高，有很多国家和城市仍处于合作的边缘区域，核心成员仍在合作网络中起关键作用。合作学科方面，临床医学、工程学、化学、材料科学及物理学是大湾区科研合作的重要领域，近年来工程学领域的合作规模发展迅猛，国内层面对临床医学领域的关注度略低于区域内部和国际层面。