该研究对中国黑龙江、吉林、辽宁、安徽、山东、内蒙、河南、河北、江苏、安徽、浙江、湖北、福建、广东、海南、上海等省、市进行了猪流感的自清学和病原学调查研究,对3895份中国不同地区猪血清进行抗体检测,1306份鼻棉拭子或死亡猪肺、气管样品用鸡胚培养增殖,阳性培养物进行血清学、形态学及生物学特性鉴定.以无限稀释克隆法对分离自中国东北、华北、华中、华东、华南等不同地区29株H3N2亚型SIV分离物及2株人流感病毒进行纯化,并对其生物学特性进行了比较研究.在此基础上,对29株SIV分离株和2株人流感病毒分离株抗原变异率高并与其致病性和宿主特异性密切相关的外部基因HA、NA以及决定其型特异性的内部基因NP、M和编码非结构蛋白的NS基因进行了RT-PCR扩增、克隆和核苷酸序列测定,对核苷酸序列及其推导的氨基酸序列进行比较和分析,构建HA、NA、NP、M及NS基因核苷酸和氨基酸的遗传发育进化树,并对其分子流行病学及遗传演化进行分析.该研究首次在全国大范围内从血清学和病原学开展SI生态学和流行病学的调查研究,证实中国猪群已普遍感染H3亚型SI;黑龙江、福建、浙江、山东、内蒙、广东等省的猪群中同时存在H3、H1及其它亚型SIV;抗SWTN77（H1）、SWCO77（H3）、DKAT69（H1）、TKUK63（H3）流感病毒抗体已出现于中国东北、华北、华东、华南等工区多个省市的猪群中.