CCDC62基因多态性位点rs12817488与中国汉族人群帕金森病易感性相关

来源 :温州医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kuaijizhidu2009
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背景:  帕金森病(Parkinsons disease,PD)是一种复杂的神经变性疾病,65岁以上的老年人帕金森病患病率为1-2%,帕金森病病因包括多种基因及环境因素,也包括二者复杂的交互作用。最近,国际帕金森病组织通过对5个全基因组关联研究数据的mata分析,得出了5个新的与PD相关的基因(ACMSD, STK39, MCCC1/LAMP3,SYT11以及CCDC62/HIP1R)。继而很多研究在不同人群中验证这些新发现的位点与PD的关系,由于芯片设计等原因,其中CCDC62基因多态性位点rs12817488并未直接研究,而是通过一个代理的连锁位点rs10847864/HIP1R间接反映其与PD的关系。卷曲螺旋域蛋白62(Coiled-coil domain-containing protein62,CCDC62)与雌激素受体激活相关,而PD与雌激素及雌激素受体有密切关系。已有研究证实,PD与雌激素相关位点有一定的关联性,因此我们直接研究rs12817488/CCDC62位点与中国大陆人群PD的关系。  目的:  探讨CCDC62基因多态性位点rs12817488与中国汉族人群PD的关联性;在蛋白水平上研究不同基因型CCDC62蛋白表达情况;探讨另一雌激素位点rs2697962/PRDM2与同一人群PD的关联性,并主要探讨两位点的有无潜在的交互作用。  方法:  1.通过聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(Polymerase chain reaction andrestriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)的方法研究rs12817488多态性位点在341个散发性PD病人(178个男性和163女性)和423个健康对照(226男性和197女性)的基因型情况;PD和对照组性别年龄匹配,均来是自于中国大陆东部的汉族人群。  2.在蛋白水平上,取41个基因型为纯合子的PD和健康对照的外周血,分离外周血单个核细胞(Peripheral blood mononuclear cells,PBMCs),提取蛋白,进行免疫印迹实验,观察四组(PD AA,PD GG,Control AA,Control GG)的CCDC62蛋白水平。  3.通过PCR-RFLP的方法研究rs2697962多态性位点在同一人群中的基因型分布情况;多元logistic回归用于两个多态性位点的交互作用分析。  结果:  1.Rs12817488/CCDC62A等位基因的基因频率在PD组显著高于对照组(P=0.006,OR1.327,95% CI1.083-1.626),A等位基因是PD的危险等位基因。PD组和对照组基因型分布有统计学意义(P=0.011 for AA vs.AG vs.GG;P=0.003 for AA vs.AG+GG,OR1.604,95% CI1.175-2.190)。进一步作性别和年龄分层分析,性别分层分析发现仅仅女性PD组和对照组基因型和等位基因存在统计学差异(P=0.019 for AA vs.AG vs.GG; P=0.009,OR1.481,95% CI1.102-1.991 for A vs.G),男性PD和男性对照基因型和等位基因无统计学差异;年龄分层分析发现rs12817488与PD相关性仅存在于晚发性PD和对照组比较(基因型分布P=0.014;等位基因分布P=0.011),早发性PD和对照组基因型和等位基因比较无统计学差异。Rs12817488基因型和等位基因分布与PD三种运动分型,即震颤为主型、强直少动型、混合型,无相关性,与PD临床评分,即帕金森综合评分量表评分和Hoehn-Yahr分级无关。  2.PDAA组的蛋白表达水平明显比其他组别高: PD AA组是对照AA组蛋白表达水平的1.46倍,是对照GG组蛋白表达水平的1.78倍,有统计学意义(P<0.05);其他基因型的蛋白水平之间比较无统计学意义。  3.Rs2697962/PRDM2PD组和对照组基因型和等位基因卡方检验结果均无统计学意义,对应性别比较的性别分层分析也无统计学意义,而女性PD组和男性PD组比较基因型和等位基因均有统计学意义,从基因型和最小等位基因A在女性PD较男性PD高(P=0.019 for AA vs.AG vs.GG; P=0.008 for A vs.G)。我们进一步分析两位点即rs12817488/CCDC62和rs2697962/PRDM2对PD可能存在的交互作用。我们的统计结果表明,在总PD组和对照组中rs12817488 AA型和rs2697962 A等位基因同时出现时增加患病风险(OR1.636,95% CI1.007-2.656,P=0.047);进一步在女性PD组和女性对照组中分析,统计结果表明rs12817488 A等位基因和rs2697962 AA型同时出现时增加PD患病风险(OR5.687,95% CI1.112-29.086,P=0.037).  结论:  总之,我们的研究首次证明rs12817488多态性位点与中国汉族人群散发性PD易感性相关,而且与性别、发病年龄有关,与PD运动分型和临床评分无关。我们进一步研究了该位点不同基因型对应的蛋白水平变化,CCDC62蛋白表达水平与rs12817488基因型有关,PD AA型蛋白表达水平较高。该位点与另一个PD相关的雌激素位点即rs2697962/PRDM2有一定的交互作用。
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