应用cDNA芯片筛选膀胱移行细胞癌差异表达基因及验证研究

来源 :兰州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hjzxxhjzxx
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的应用高通量cDNA芯片检测膀胱移行细胞癌(BTCC)与正常膀胱黏膜组织基因表达谱,筛选共同差异表达基因,初步探讨BTCC发生发展的分子机制,以期发掘潜在肿瘤特异基因。方法1.采用高通量cDNA芯片对6例的BTCC及3例癌旁正常膀胱黏膜组织基因表达谱进行检测,筛选共同差异表达基因,进而将其导入博奥生物分子功能注释系统MAS3.0进行GO功能分类及pathway生物信息学分析。2.采用实时定量RT-PCR对4个显著差异基因的表达进行检测,对基因芯片结果的可靠性进行验证。结果1.芯片结果共筛选出263个膀胱移行细胞癌共同差异表达基因,其中表达上调2倍以上的基因有92个,表达下调2倍以上的基因有171个。差异基因GO功能分类涉及DNA转录与转录调节、细胞分裂、细胞周期、蛋白代谢分解、细胞凋亡和抗细胞凋亡、细胞增值、免疫应答、DNA复制与修复等。差异基因通路涉及细胞周期通路、DNA聚合通路、泛素介导的蛋白通路、错配修复通路、P53信号通路、氧化磷酸化通路、细胞因子及其受体相互作用通路、PPAR信号通路、TGF-β信号通路等。2.实时定量RT-PCR结果显示,四个基因TOP2A、CDK1、BIRC5A、CAV1的相对表达量分别为10.45、5.35、28.46、0.14倍,与基因芯片结果的总体趋势基本一致。结论1.基因芯片筛选出大量差异表达基因,通过GO功能富集和通路富集分析,充分证明BTCC的发生是一个涉及多基因、多步骤、多途径调控的复杂过程。实验所筛选的差异基因表达谱及肿瘤相关基因对膀胱癌的诊断具有重要的意义。2.采用实时荧光定量PCR对芯片结果中TOP2A、CDK1、BIRC5A、CAV1基因的表达进行检测,进一步验证芯片结果的可靠性,并发现这些基因有可能成为诊断BTCC的潜在的标志物。
其他文献
随着网络信息技术和智能设备制造能力的提高和推广,新兴媒介得到了迅速发展。开放社会的思想和价值判断的多元化,不良社会思潮向网络虚拟世界的渗透,虚拟社区群体理性缺失,相
<正>为规范县乡财政管理,提高县乡财政公共支出保障能力,馆陶县从在2010年起积极探索推行县乡财政体制改革。近年来,按照省、市的统一安排部署,县乡财政体制改革工作扎实推进
“民有所呼,我必有应”不仅是理念,更是行动。这八个字,应该是我们的城市、我们的机关、我们的各级干部都应该遵循的工作准绳。$$进入新时代,人民对美好生活的需求日益广泛,不仅对
报纸
康复服务是现今精障人士较为需求的社会服务项目之一,但是从目前来看,精障人士的康复却受到各种现实条件的制约。对于精障人士来说,当服务是本社区可及的,那他们是可以在自己
古诗词是中国文化的重要载体和表现形式,茶文化也是中国传统文化的重要内容。在古诗词文化的影响之下,茶逐渐超越了作为饮品的物质层面,步入了中国人的精神生活。古代中国人
本文在农村商业银行业务质量普遍较低、服务功能单一的现状中,提出在供给侧结构性改革应当向轻型化、社区化、智能化、精细化方向发展,并对此提出了几点思考,以期对农村网点
在8个浸胶车间和1个针织车间里的30条生产线上,销往美国、英国、日本、巴西等国家及国内多省市的劳保手套在不停地经过各道工序最终成为成品。身着蓝色工作服的工人熟练地将
体育用品销售行业的空间分布是体育地理学研究的重要内容之一。采用文献资料法、实地调查法、数据统计法、个案分析法等研究方法,对烟台市体育用品销售行业的空间分布进行了
目的总结完全胸腔镜下二尖瓣置换手术的体外循环建立方法和体外循环的管理。方法45例风湿性心脏病二尖瓣狭窄伴关闭不全患者,采用完全电视胸腔镜下进行了二尖瓣置换术,并对体
状语从句可以放在主句之前或之后。状语从句位置的制约因素越来越受到国外认知语言学界的关注。尽管已有研究表明状语从句的置位分布取决于语义、话语语用特征以及认知加工等