区域经济发展与地方政府职能定位是近年来我国理论界与实践中面临的重大课题，为社会各界关注。本文以利益为基本出发点，通过利益将行政区与经济区有机地联系起来，为进一步综合讨论区域经济问题与地方政府职能问题打下基础；本文对地方政府的利益进行细分，包括地区利益、组织利益和个人利益，有助于从根本上解释地方政府行为的复杂性；本文研究的两大问题，即区域经济问题与地方政府职能问题，并不是平行的，而是先确定区域经济协调发展为宏观目标，然后再为地方政府定位；本文还结合时代特征(即社会转型、西部大开发和中国入世)，使对地方政府职能定位更具现实意义，其中也提到了如诚信、城市经营、“竞合”关系等具有时代特色的名词。 本文在写作中运用了制度经济学理论、公共选择理论和政府干预理论等相关知识，始终贯穿着系统论思想和动、静态分析方法，有助于对问题论述的充分性和彻底性。 本文分为三部分，沿着提出问题——分析问题——解决问题这一思路展开论述。第一部分内容包括指明我国正处于政府主导型区域经济合作组织阶段，描述我国区域经济差异存在并扩大的现象并明确了地方政府在区域经济发展中的作用之大，还对区域与地方政府相关概念进行界定，主要阐述了地方政府在区域经济发展中非理性行为的特征和表现；第二部分对地方政府非理性行为进行剖析，包括静态与动态、制度与观念等因素；第三部分为地方政府在区域经济协调发展中定位，即区域内提高竞争力，区域之间加强合作。