目的甲状旁腺癌是罕见的内分泌肿瘤,其诊断困难且预后不佳。目前,甲状旁腺癌的发病机制尚不明确,其诊断及分型尚缺乏有效的标志物。本研究旨在从基因组和转录组水平,分别对散发性甲状旁腺癌的候选诊断标志物进行系统性筛选和验证,并探讨其生物学功能及潜在临床应用价值。方法本研究收集了 23例甲状旁腺癌和41例甲状旁腺腺瘤病人的临床资料及肿瘤标本,利用全基因组重测序技术分析基因组编码区和非编码区的变异频谱和特征,采用高通量表达谱芯片筛选长链非编码RNA（long non-coding RNA,lncRNA）、环状RNA（circular RNA,circRNA）、mRNA标志物,应用多种生物信息学方法对候选标志物进行功能预测和共表达分析,采用Sanger法测序、反转录-实时荧光定量PCR（quantitative real-time reverse transcription PCR,RT-qPCR）、免疫组织化学染色、原位杂交、荧光原位杂交技术对上述lncRNA、circRNA、mRNA及微小RNA（microRNA,miRNA）候选标志物在扩大样本中进行验证。采用二分类logistic回归分析及受试者工作特征曲线分析评估模型鉴别诊断效率。结果利用全基因组重测序技术发现:散发性甲状旁腺癌中最常见的基因变异为CDC73（39.1%,9/23）。CDC73基因变异与肿瘤突变负荷增加（P=0.026）及肿瘤复发和转移（P=0.007）显著相关。78.3%（18/23）的甲状旁腺癌样本中检测到PI3K/AKT/mTOR通路基因变异。在野生型CDC73基因的肿瘤样本中,突变基因主要富集在抗原递呈和自身免疫性疾病相关通路中。利用lncRNA表达谱芯片检测发现:同甲状旁腺腺瘤相比,甲状旁腺癌共检出2165个差异表达mRNA及2641个差异表达lncRNA;生物信息学分析发现甲状旁腺癌与细胞外基质受体作用及能量代谢相关通路相关,而ATF3、ID1、FOXM1、EZH2、MITF可能是上游核心调控因子;“平台型”趋势在差异表达的lncRNA和mRNA中显著性最强;候选验证的lncRNA中,lncRNAPVT1和lncRNAGLIS2-AS1对甲状旁腺癌具有最高鉴别诊断效率,曲线下面积（area under curve,AUC）分别为0.871（P<0.001）和0.860（P<0.001）。利用circRNA芯片检测发现:甲状旁腺癌共有2521个表达上调的circRNA和2232个表达下调的circRNA。其中,hsacirc0075005在鉴别甲状旁腺癌时具有良好的诊断效率,其AUC为0.770（P=0.001）。hsacirc0035563高表达水平与甲状旁腺癌病人携带CDC73基因突变（P=0.022）及疾病复发（P=0.042）显著相关。利用RT-qPCR技术发现:甲状旁腺癌组织中 miR-222 表达水平显著升高（P=0.041）,而 miR-139、miR-30b、miR-517c、miR-126*均显著降低（P<0.05）。miR-139联合miR-30b具有最高鉴别诊断效率,其AUC达0.888（P<0.001）。此外,miR-30b与血清总钙、全段甲状旁腺素（intact parathyroid hormone,iPTH）及碱性磷酸酶水平呈显著负相关（P<0.001）。结论在中国散发性甲状旁腺癌人群中,CDC73基因与PI3K/AKT/mTOR通路基因发挥了重要致病作用,有望成为基因组水平潜在的诊断标志物。同时,lncRNAPVT1、lncRNA GLIS2-AS1、hsacirc0035563、hsacirc0075005、miR-139 联合 miR-30b等多个RNA转录本对甲状旁腺癌发生的分子机制研究有重要意义,有望成为转录组水平的新型诊断标志物和治疗靶点。