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棉花是重要的经济作物，是天然纤维的主要来源。对棉花基因功能的研究将为其遗传改良提供理论依据。本研究从陆地棉（Gossypium hirsutum L. ）cDNA文库中筛选到一个SINA同源基因，命名为GhSH1a。序列分析表明该GhSH1a cDNA全长1394 bp，拟编码339个氨基酸。GhSH1a蛋白与果蝇SINA和人类SIAH有30％左右的相似性，GhSH1a蛋白与拟南芥中的SINAT5有78％的相似性。SINA（Seven in absentia）蛋白家族成员的共同结构特征是具有高度保守的N-端C3HC4 Ring finger结构域。SINA蛋白通过这个结构域使靶蛋白质泛素化并随后被蛋白酶体降解，C-端序列具有与其他蛋白结合的功能。 SINA基因最初是在果蝇中克隆到。果蝇的SINA蛋白在眼睛R7感光细胞命运决定过程中起着关键的作用。哺乳动物SIAH1参与细胞的程序性死亡。拟南芥SINAT5具有泛素蛋白连接酶E3活性，弱化生长素信号，控制植株侧根的发育。然而，对棉花SINA同源蛋白功能的研究还未见报道。根据已知SINA蛋白的功能，尤其是拟南芥SINAT5的功能，以及生长素对棉纤维细胞和植物侧根分化和发育的重要调节作用，推测本研究中的GhSH1a可能调控棉花侧根的发育，或影响棉纤维细胞的分化、伸长。 本研究根据GhSH1a cDNA的5’-和3’-末端序列设计引物，以棉花基因组DNA为模板扩增出GhSH1a的基因片段，然后将该片段克隆到pGEM-T Easy载体中进行测序。将GhSH1a的基因序列与cDNA序列比较发现，该基因长2631 bp，由3个外显子和2个内含子组成。 通过RT-PCR进行组织表达特异分析，发现GhSH1a在根、茎、叶、花、5DPA、10DPA、15DPA的纤维中都有转录；在根、花、5DPA纤维中转录水平稍高。说明GhSH1a蛋白在各种组织中是必需的，而在分化程度较高的组织中有较高水平的表达。因此推断GhSH1a可能与细胞分化有关。 分别以GhSH1a cDNA 5’-末端212 bp和3’-末端451 bp序列为探针与基因组DNA酶切片段进行Southern blot杂交分析，结果显示5’-末端的探针杂交的信号条带较少，表明5’-末端序列有较高的特异性；而3’-