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芦苇(Phragmites communis Trin.)是一种多年生草本植物,其典型生境为水沼,河流及其周边地带。但它可适应广泛甚至高度不良的陆地生态环境,并演化出多种生态型。甘肃河西走廊广泛分布有芦苇的四种生态型,根据其生境特征分别称作:水生芦苇,沙丘芦苇,轻度盐甸芦苇和重度盐甸芦苇。长期以来针对四种生态型芦苇的植物生理、生化及分子生物学等不同方面已进行了大量的研究,本文在前期工作的基础上利用RAPD和等位酶方法分析了四种生态型芦苇的遗传多样性,并用生物信息学方法对在沙丘芦苇根茎中特异表达的胸腺嘧啶二磷酸葡萄糖脱水酶(PcTGD)进行了序列分析和结构预测。主要结果总结如下:1、四种生态型芦苇的多态位点百分率(P)的均值为34.1%,平均预期杂合度(He)为1.31,均高于植物在居群水平上的值,表现出较高的遗传多样性。而轻度盐甸芦苇和重度盐甸芦苇P值在均值之下,水生芦苇和沙丘芦苇P值在均值之上,因此推测轻度盐甸芦苇和重度盐甸芦苇是从水生芦苇或沙丘芦苇中进化出去的。2、遗传距离的分析表明水生芦苇和轻度盐甸芦苇的遗传距离最大,沙丘芦苇和重度盐甸芦苇的遗传距离最小。RAPD和等位酶方法对遗传距离的分析结果的差异趋势是一致的3、种生态型芦苇的内繁育系数(F)均小于0,而同时又具有一个较低的外交率,暗示者芦苇虽然主要以营养方式繁殖,但在一个相对较长的时期,其繁殖方式并不是由无性的方式所主宰的。4、沙丘芦苇胸腺嘧啶二磷酸葡萄糖脱水酶(PcTGD)的序列分析。用ProtScale进行疏水性分析,GOR进行二级结构预测。结果为PcTGD在一级结构上以亲水为主,螺旋、折叠及卷曲所占百分比分别为26.9%、23.4%和49.7%。5、用PSORTⅡ进行亚细胞定位的分析,多种方式的计算推测的结果均表明PcTGD的亚细胞分布最大可能是细胞质6、用BLASTP在PDB和SwissProt中搜索TGD的同源蛋白质,用CLUSTAL W进行多序列比对。在MODELLER中得到预测的三级结构,并用PROCHECK对所得结构进行合理性检测。7、发现PcTGD具有两个高度保守的活性中心Gly*Gly**Gly和Tyr***Lys,此活性中心属于一个短链脱氢酶/还原酶(SDR)的家族,且PcTGD的核酸和蛋白序列均与SDR家族同源性非常高(90%和27%),说明PcTGD属于此家族。