目的探究载脂蛋白E（ApoE）基因多态性、低密度脂蛋白（LDL）和高密度脂蛋白（HDL）亚类与肝癌的易感性、鉴别价值和发生风险因素的关系,为肝癌早期诊断和风险评估提供依据。方法选取我院2018年12月至2020年12月113例原发性肝癌患者和同期70例乙型病毒性肝炎患者,体检中心健康体检者80人,将其分组为肝癌组、肝炎组和对照组。采集血清分别用基因芯片法和蛋白电泳法检测ApoE基因多态性和LDL、HDL亚类水平。将入组对象按ApoE等位基因分为E2、E3和E4组,对基本信息进行分析,比较肝癌组和肝炎组ApoE基因多态性的分布和LDL、HDL亚类水平,分析ApoE基因多态性与肝癌的易感性和LDL、HDL亚类水平对肝癌及肝炎的鉴别价值,运用受试者工作曲线（ROC）确定截断值,并采用单因素分析组间各指标初步筛选肝癌发生的危险因素,进一步用logistics回归分析多因素与肝癌发生风险的关系。结果1、肝癌组、肝炎组和对照组中?3/?3基因型最常见,最少见的为?2/?2基因型,其中对照组?2/?2基因型未检出,?2等位基因频率肝癌组要高于肝炎组和对照组,差异有统计学意义（P<0.05）,各组间?3、?4等位基因频率无明显差异（P>0.05）。2、入组患者中,不同ApoE基因表型在性别、年龄、吸烟因素的比较中,差异无统计学意义（P>0.05）,具有可比性;肥胖和饮酒与肝病相关,差异有统计学意义（P<0.05）。3、肝癌组大而松低密度脂蛋白（IbLDL）、高密度脂蛋白2（HDL2）水平高于肝炎组,小而密低密度脂蛋白（sd LDL）、高密度脂蛋白3（HDL3）水平低于肝炎组（P<0.05）。IbLDL、sd LDL、HDL2、HDL3鉴别肝癌及肝炎的AUC分别为0.701、0.548、0.650、0.741,说明HDL3对鉴别肝癌及肝炎最有价值。4、IbLDL≥45.75、HDL2≥25.72、携带?2等位基因是影响肝癌发生的危险因素（P<0.05）。结论肝癌组?2等位基因频率为10.62%,明显高于健康对照组和肝炎组,说明携带?2等位基因的人对肝癌有易感性。肥胖和饮酒会导致肝病患病率高,但不是肝癌发生的独立危险因素。IbLDL、HDL2和携带?2等位基因与肝癌的发生风险呈正相关,且与IbLDL、sd LDL、HDL2相比较,HDL3水平对肝癌及肝炎更具有鉴别价值。