纳米尺度下吸附在石墨表面的谷胱甘肽的探测和模拟研究

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蛋白质的吸附现象已经在生物医学材料、生物医学工程等领域得到广泛应用。扫描隧道显微镜作为一种高分辨的表面分析技术,可以纳米尺度下对吸附的蛋白质进行探测,但是对于得到的图像的分析,仍然存在问题。分子模拟技术是近年来发展起来的一门新兴技术,为从微观水平研究自然现象提供了一种十分有效的理论研究方法,并且可以用来帮助分析STM图像。其中的分子动力学模拟方法不仅可以用来研究系统的静态性质,还可以研究系统的动态过程,是蛋白质结构研究中的重要理论工具之一。采用分子动力学模拟方法研究蛋白质吸附过程,可以从微观水平上研究蛋白质吸附的动态过程和机理。   本文首先通过设计电路,使的针尖在制作过程中能够自动切断电流,提高了针尖的品质。然后,在扫描隧道显微镜的探针上包裹绝缘物质,使其能够在水溶液中工作,通过在水溶液中扫描石墨,证明了这种方法的可靠性,并且进一步在水溶液中获得谷胱甘肽的扫描图像。   由于对扫描隧道显微镜的图像解释存在问题,所以本文还采用了分子动力学模拟技术。在NVT条件下,采用SPM水分子模型和GROAMCS力场,在不同浓度下模拟了GSH的吸附。通过各个体系的RMSD,Ramachandran Plot,构象伸缩性来表征GSH。通过比对谷胱甘肽的各个基团与石墨之间的距离,确定出对于吸附起主要作用的因素。探测和模拟结果表明,稀溶液的条件下石墨表面对谷胱甘肽的影响较小,而在谷胱甘肽的浓溶液中,石墨显著影响了谷胱甘肽的构象,其中谷氨酸和半胱氨酸的巯基对于吸附其主要作用。
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