长江流域云南段位于长江水系上游,独特的地理位置决定了流域内地表水环境不但对云南省的国民经济和社会发展产生影响,同时也对长江中下游地区水环境质量安全意义重大。长江流域作为云南省城镇化水平最高的区域,工业点源及农业面源污染的叠加为流域水环境承载能力带来严峻考验。定量识别长江流域云南段地表水污染时空分布及关键源区,对解决流域地表水污染问题,筑牢长江上游及国家西南生态安全屏障、助力云南省迈向全国生态文明建设排头兵意义重大,并为科学治污、精准治污提供理论依据和数据支撑。为此,本文基于SWAT模型构建了长江流域云南段地表水污染模拟模型,利用SWAT-CUP对模型进行率定与验证,依据模型结果对研究区域污染物负荷时空分布进行分析,并对流域污染关键源区进行了识别。研究结论如下:（1）2015～2018年水质监测数据表明流域水质环境质量持续改善。基于云南省第二次污染源普查数据构建了精确的污染点源数据库,结果表明流域总氮点源排放以集中式污染治理设施为主,工业源、农业源和生活源排放量相对较少;总磷点源排放以集中式污染治理设施和农业源排放为主,工业和生活点源占比较低。（2）构建了适用于长江流域云南段大尺度、全流域、精细化的SWAT地表水污染模拟模型。并利用龙兴村、温泉大桥、凤翥断面的径流与水质分别对流域上、中、下游进行校准与验证,采用目视法与函数指标法相结合对模拟值与实测数据拟合结果进行评价。目标函数评价结果相对较好,通过目视法发现SWAT模型模拟值在上升、下降的趋势与峰值出现的月份等方面与实测值趋势符合性较强。（3）流域总氮负荷量是总磷的2～3倍,2015至2018年总氮、总磷污染物负荷量呈现不断减少的趋势,雨季的污染物负荷强度远大于旱季,峰值为8月,最低值出现在12月或2月,污染较严重的季节是夏季,冬季污染较轻。总氮和总磷负荷强度的空间分布类似,流域的中、下游是污染负荷相对较重的区域。（4）2015～2018年耕地和林地两种土地利用类型对污染物贡献较大,耕地对总氮负荷贡献在84.30%以上,对总磷负荷量贡献在87.54%～91.46%之间;林地对总氮负荷贡献在5.18%～6.50%之间,对总磷负荷贡献在2.77%～5.31%之间。（5）基于降雨量、总氮负荷强度、总磷负荷强度划分的等级以及土地利用类型四个指标对关键源区进行识别,并依据潜在污染风险程度分为A、B、C、D四个等级。从2015年到2018年,总氮关键源区数量分别为45、31、37、23个,总磷关键源区数量分别为40、26、47、18个;总氮、总磷污染物A级关键源区主要位于流域中游和下游,B级主要位于上游和下游,C级主要分布于上、中游,D级关键源区较少,大部分位于流域下游。