Bacillus sp.LM4-2分离鉴定与全基因组分析

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我国钼矿资源多数是以低品位硫化矿(MoS2)的形式存在,这些矿物用传统冶炼工艺很难进行绿色、经济、有效地提取。故此,有效开发利用微生物资源将矿石中的有价元素选择性浸出的生物冶金技术,因其具有低成本、高效率和环境友好等特点而被广泛研究,并形成了当前世界矿物资源加工利用的前沿技术。本研究首先采用梯度稀释法从河南洛阳栾川钼矿土壤中分离纯化到一株对Mo6+具有较强抗性的菌株,基于16S rDNA对该菌株进行分子鉴定,同时对其生理生化特性进行研究,进而对该菌株进行了全基因组序列测定及基因组分析。主要研究结果如下:1)基于16S rDNA序列分析表明,所选菌株与枯草芽孢杆菌同源性最高,为95.2%,鉴定该菌株为芽孢杆菌属的一个新种,命名为Bacillus sp.LM4-2。2)对所筛选菌株Bacillus sp.LM4-2的生理生化特性研究结果表明,该菌株最适生长温度为30℃左右,最适生长pH为6,能在0.8mol/L Mo6+环境中较好生长,1.2mol/L Mo6+环境中仍然能生长,该菌的分离为冶金微生物多样性研究提供了一种新材料。3)全基因组分析表明,Bacillus sp.LM4-2基因组含有一条环状染色体,所得的序列总长度为4,069,266bp,没有质粒。该基因组共编码4153个预测的蛋白编码基因,有116个RNA基因。在所有的ORF中,有1411个能注释上已知的或是预测的功能,基因组中DNA的G+C含量为44.52%。4)代谢途径的分析结果表明,Bacillus sp.LM4-2基因组编码三羧酸循环、糖酵解、磷酸戊糖支路、氧化磷酸化所需的各种酶类和相关蛋白,编码核糖体转录和翻译、细胞运动、RNA的加工修饰、信号转导机制、细胞壁合成、DNA损伤修复、能量的产生和转换、氨基酸转运和代谢、核苷酸的转运和代谢等相关基因,说明该菌的基本代谢途径是完整的。
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