随着世界人口数量的不断增长,对粮食总产的需求也越来越高,但现有的耕地面积却因为干旱、盐碱化等原因不断退化,严重威胁粮食的正常生产。水稻是重要的粮食作物,盐碱胁迫严重威胁了水稻的正常生长,选育耐盐碱水稻不仅能扩大水稻种植面积,保证粮食产量,同时还可以对当地盐碱化土壤的理化性质进行改良。耐盐碱种质资源的筛选鉴定是选育耐盐碱水稻品种的第一步,也是至关重要的一步。本研究从探索耐盐碱筛选体系入手,对300份水稻种质资源进行幼苗期Na2CO3处理,使用苗长和生物量数据对不同水稻种质进行耐盐碱性评估,并结合基因型数据进行全基因组关联分析。本研究的主要结果如下:根据一个盐碱敏感品种空育131（KY131）和一个耐盐碱品种海稻86（SR86）在不同Na2CO3浓度下的表型反应,确定了适合水稻幼苗期耐盐碱种质筛选的Na2CO3浓度为0.3%,并用随机挑选的32份水稻材料进一步验证其可行性。通过图像处理技术结合传统人工称量,获得了 300份种质资源正常和胁迫条件下的苗长与生物量数据,根据比较苗长数据获得了 13份耐盐碱水稻品系;根据比较苗长相对值数据获得了 17份耐盐碱水稻品系;根据比较生物量数据获得了 1份耐盐碱水稻品系;根据比较生物量相对值数据获得了 3份耐盐碱水稻品系。通过隶属函数法对300份品系表型性状进行综合评价,最终确定了 SR86、W132和W1003个水稻品系具有高度耐盐碱性,其中SR86和W100均来源于轻度盐碱地。基于种质筛选相关表型数据结合种质资源基因型数据进行GWAS分析,共获得了 278个SNP位点,其中31个具有功能注释的候选基因与较显著的SNP位点关联,这些基因位点可为耐盐碱水稻分子育种提供参考。本研究中筛选得到的高度耐盐碱材料和高度盐碱敏感材料可为水稻耐盐碱遗传研究的群体构建提供参考,高度耐盐碱品系同时可作为供体亲本改良其它品种的耐盐碱性,全基因组关联分析的结果也为水稻耐盐碱分子育种提供了新位点。