【摘 要】
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龟鳖类动物是地球上历史最古老的物种之一,然而由于近年来人类活动扩张、捕杀以及环境恶化等原因导致很多龟鳖类动物濒临灭绝。为了深入了解珍稀濒危类龟鳖动物系统发育关系与生物进化历史,并且提供更多的物种遗传信息来对其进行保护和繁育,本研究采用二代高通量测序和克隆Sanger测序技术相结合,获得了缅甸平胸龟、亚洲鳖、斑鳖和云南闭壳龟四种珍稀濒危龟鳖类物种的线粒体基因组,并且对其线粒体基因组信息、系统发育和分
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龟鳖类动物是地球上历史最古老的物种之一,然而由于近年来人类活动扩张、捕杀以及环境恶化等原因导致很多龟鳖类动物濒临灭绝。为了深入了解珍稀濒危类龟鳖动物系统发育关系与生物进化历史,并且提供更多的物种遗传信息来对其进行保护和繁育,本研究采用二代高通量测序和克隆Sanger测序技术相结合,获得了缅甸平胸龟、亚洲鳖、斑鳖和云南闭壳龟四种珍稀濒危龟鳖类物种的线粒体基因组,并且对其线粒体基因组信息、系统发育和分歧时间进行研究。主要结果如下:1.本研究通过测序获得缅甸平胸龟（Gen Bank:MK680534）、亚洲鳖（Gen Bank:MT039230）、斑鳖（Gen Bank:MT039229）和云南闭壳龟（Gen Bank:MT334601）4个物种线粒体基因组。除缅甸平胸龟线粒体基因组发生大规模重排事件外,斑鳖、亚洲鳖和云南闭壳龟均为典型排列结构。2.在系统发育分析中显示:（1）缅甸平胸龟与（中国平胸龟+越南平胸龟）形成姐妹群关系;（2）在鳖科中,亚洲鳖与黑鳖亲缘关系最近,斑鳖则与滑鳖亲缘关系最近;（3）在闭壳龟属中,云南闭壳龟与三线闭壳龟、金头闭壳龟、潘氏闭壳龟形成姐妹群关系。此外,遗传距离统计结果显示,缅甸平胸龟与中国平胸龟、缅甸平胸龟与越南平胸龟的遗传距离较大,已经达到了闭壳龟属和拟水龟属内的种间遗传距离。3.通过分子钟估算分歧时间显示:（1）平胸龟3个亚种的最近共同祖先可推测至中新世,这一时期的青藏高原隆升可能阻断了缅甸平胸龟与中国、越南平胸龟之间的基因交流;（2）鳖科的物种多样性的爆发与古新世和中新世两个全球变暖时期有明显的对应关系;（3）闭壳龟属的分化共同节点出现在约为近新纪早期,而这段时间的一系列复杂的气候地质事件可能导致了闭壳龟属在短期内迅速分化成种。本研究通过对4个龟鳖类物种的线粒体基因组信息、系统发育和分歧时间的分析研究,不仅进一步完善了这些濒危物种的系统发育关系,并且为清晰揭示上述生物类群的谱系地理及演化历程提供了重要的线索,为后续开展适当的保护和繁育工作提供了重要的理论依据。
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