BmDNV-5(信大株)的感染增殖及其基因组研究

来源 :西南农业大学 西南大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:cds123
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在养蚕业中,每年因蚕病造成的损失巨大,其中由家蚕浓核病毒(BmDNV)引起的家蚕浓核病是主要的蚕病之一。BmDNV-5(信大株)是一株新分离到的家蚕浓核病病毒。为彻底解明该新发现病毒的生物学特性和背景,本文首先用QC-PCR法对该病毒在家蚕中肠细胞的感染增殖情况进行了调查。结果表明,感染3小时后,中肠后部病毒DNA量较其他部位稍高,但随后中肠前部、中部增殖速度加快,总的趋势是从中肠前部开始增殖后向中部、后部逐渐推移,经96-120小时后,中肠各部位增殖量都达到稳定的峰值。 其次,对BmDNV-5(信大株)的基因组DNA全序列进行了分析。推测其有四个开放阅读框,其中ORF1、ORF3编码非构造蛋白,ORF2编码构造蛋白。病毒基因组DNA的两末端存在232bp的反向重复序列(ITR)和161bp的发夹结构,这与许多其它昆虫浓核病病毒相类似。进化分析表明,BmDNV-5(信大株)与BmDNV-1(伊那株)存在很高的同源性,昆虫浓核病病毒的同源性与其宿主的分类有关,细小病毒科病毒的进化是典型的宿主依赖性进化。 同时,用分段克隆后再连接的方法,进行了BmDNV-5(信大株)全克隆的构建尝试。序列测定表明,成功地构建了分段克隆,但分段克隆的连接尚未成功。推测是两末端的ITR结构影响了全克隆的稳定性。探讨了ITR结构对全克隆的影响因素。
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