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本文对进化基因组学进行了研究。主要内容如下：
一是Ka-Ks的正相关现象的研究。利用已有的大量数据并结合多种统计手段来分析这个问题，结果提示Ka-Ks的正相关是由突变和选择两者共同造成，且基因间非同义取代不均一的选择对观察到的Ka-Ks相关的贡献更大。
二是持家基因和特异基因的进化模式的研究。发现特异基因的一些序列特征随时间逐渐发生变化且向持家基因的特征靠近，提示过去认为只作用于持家基因的选择力量同时也显著的影响着特异基因的进化。
三是G4 DNA的信息学分析。经对13个物种的序列分析表明，G4 DNA在温血动物转录调控区大量富集，证明这种富集是高等动物中对G4 DNA连续选择的结果。