基于荧光原位杂交的燕麦属物种种间关系研究

来源 :四川农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jimchenstong
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燕麦属(Avena L)隶属于禾本科(Poaceae),早熟禾亚科(Pooideae),燕麦族(Aveneae),全世界约有30个种。由4种基因组组成AA、CC、AABB、CCCC、AACC/CCDD、AACCDD 6种基因类型。由于燕麦基因组庞大复杂,种间关系不清晰,各染色体间同源关系不明,无法对各染色体进行识别,基于此,本研究利用简单重复序列探针,系统的标记了二倍体、四倍体、六倍体燕麦染色体,对不同探针的标记结果进行比对,同时结合45S和5S序列探针在燕麦染色体上的定位情况,分析不同倍性和不同基因组组成的物种间的亲缘关系,同时对燕麦基因组各染色体进行区分识别,并对不同物种中相同基因组各染色体间的同源关系进行了研究。1、45S和5S序列探针标记结果显示,45S r DNA均有规律的分布在随体染色体上,而5S r DNA的分布不具有规律性,主要分布在燕麦A基因组和D基因组上。2、通过分析简单重复序列探针的信号发现:A基因组二倍体之间存在丰富的遗传变异;As基因组的A.lusitanica可能更类似于Ad基因组;Al基因组的A.longiglumis同As基因组的A.atlantica、A.brevis、A.wiestii信号相似,亲缘关系更近;As基因组的A.nuda与Ac基因组的A.canariensis的信号分布更加的相似;供试的3个C基因组二倍体物种A.clauda、A.eriantha和A.ventricosa之间信号差异较大,每个种之间的信号都存在差异。3、AB基因组四倍体中A.barbata与其他三个种的结果差异较大,基于本研究结果认为AB基因组四倍体的起源可以分为三个分支,A.abyssinica和A.vaviloviana可以归为一个起源路径、A.agadiriana和A.barbata均为各自独立的起源路径;结合探针信号可以发现A基因组和B基因组之间信号差异巨大,更支持AB基因组四倍体为异源起源的说法;Ad基因组二倍体可能是AB基因组四倍体中B基因组的供体,而As基因组可能为A基因组的供体。AC(CD)基因组四倍体中,A.maroccana和A.insularis的亲缘关系更近,与A.murphyi的差异较大;通过对结果的比较分析认为AC(CD)基因组四倍体燕麦物种的基因组组成为CD,而不是AC。4、燕麦六倍体的各个种之间差异较小;As基因组二倍体可能为六倍体A基因组的供体;而C基因组的供体尚无定论;推测A.canariensis为六倍体D基因组的供体;对比AC(CD)基因组四倍体和六倍体的结果,发现A.maroccana和A.insularis与六倍体的关系更近,尤其四倍体A.insularis与六倍体A.sterilis的关系较近。
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