脑卒中和抑郁症之间的桥梁基因和机制研究

来源 :右江民族医学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:fengk9000
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:本研究旨在从研究脑卒中和抑郁症之间桥梁基因和机制的角度分析,寻找脑卒中后抑郁(post-stroke depression,PSD)潜在发病机制。方法:1.从GEO(Gene Expression Omnibus)数据库中下载脑出血(intracerebral hemorrhage,ICH)及抑郁症患者脑组织的基因表达谱数据,分别进行差异表达分析,筛选出两者差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。用所得DEGs,基于GO(Gene Ontology)和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)进行基因富集分析,得到ICH和抑郁症的功能及通路,cross-talk分析提取ICH和抑郁症的互作基因,综合桥梁景观分析鉴定核心桥梁基因。2.从GEO数据库中下载缺血性脑卒中及抑郁症患者脑组织的基因表达谱数据,分别进行差异表达分析,筛选出两者DEGs。用所得DEGs,基于GO和KEGG进行基因富集分析,得到缺血性脑卒中和抑郁症两者的功能及通路,cross-talk分析提取缺血性脑卒中和抑郁症的互作分子。3.大鼠模型的建立:选用内皮素-1皮层内注射法建立局灶缺血模型大鼠,脑卒中模型建立完成后进一步结合孤独饲养法、慢性不可预见性温和刺激(chronic unpredictable mild stress,CUMS)建立单纯抑郁及PSD模型。4.桥梁基因表达的验证:实时荧光定量聚合酶链反应(Real-time PCR)检测正常对照组、脑卒中组、单纯抑郁组、PSD组大鼠前额叶的互作基因S1PR4、CLOCK、NLK、PLK2的表达结果。5.对实验结果数据采用SPSS22.0版本软件进行统计分析。结果:1.在脑出血和抑郁症数据差异表达分析中,找到了ICH和抑郁症的DEGs。在富集分析中,找到了55个ICH和抑郁症的互作基因共同参与的功能及通路,10个与ICH和抑郁症的cross-talk最显著相关的功能,10个与ICH和抑郁症的cross-talk最显著相关的通路。cross-talk分析中,鉴定出131个ICH和抑郁症的互作基因。在综合桥梁景观分析中,鉴定出20个ICH和抑郁症的核心桥梁基因。进一步分析中发现,内吞、细胞粘附分子、吞噬可能通过多巴胺系统、5-羟色胺能信号通路在脑出血后抑郁中发挥作用。HLA-A可能通过免疫介导和细胞粘附作用同时在ICH和抑郁症这两个疾病的发生发展中发挥作用。JUN和HMOX1作为HLA-A的互作基因,可能参与了这一机制。2.在缺血性脑卒中和抑郁症数据差异表达分析中,找到了缺血性脑卒中和抑郁症的DEGs。在富集分析中,找到了24个缺血性脑卒中及抑郁症的互作基因共同参与的功能及通路。在cross-talk分析中,得到72个缺血性脑卒中和抑郁症的互作基因。3.RT-PCR检测:正常对照组、单纯卒中组、单纯抑郁组、PSD组大鼠模型大脑前额叶皮层的S1PR4(P>0.05)、CLOCK(P>0.05)、NLK(P>0.05)、PLK2(P>0.05)的相对表达量差异均无统计学意义。结论:1.通过生物信息学的分析,我们鉴定了ACTL7A、RACGAP1、PRKAG1、CDH12、DYNLL2、VCAM1、SPHK1、GOLGA2、METRNL、KLRC1、JUN、ITGA2B、CDH5、TOLLIP、ANXA2、HLA-B、TAP2、ITGA5、HLA-A、HMOX1等可能与脑出血后抑郁的相关的核心桥梁基因,以及一些可能参与了脑出血后抑郁的生理病理机制的功能及通路,为脑出血后抑郁的进一步研究提供了候选分子、功能及通路。2.我们还鉴定了ACE2、FBXO43、ASB17、CDKN1A、STK3、AGTR1、PPP2CB、STUB1、WWTR1、CAMK2B、ESCO2、CCNB3、IL6、MYB、NTRK1、FUT3、E2F2、CREB3L3、MAD2L1、MEN1、POLR2H、PSMD14、SHC3、ST3GAL3等72个可能与缺血性脑卒中后抑郁相关的桥梁基因,以及24个可能参与缺血性脑卒中后抑郁的功能及通路,为缺血性脑卒中后抑郁的进一步研究提供了候选分子、功能及通路,为进一步研究PSD的发病机制提供一些参考。
其他文献
目的:观察血糖控制对糖尿病皮肤溃疡患者血清外泌体miR-21-5p表达及创面修复的影响,探讨血糖控制对糖尿病皮肤溃疡创面修复的作用机制,为临床应用提供理论依据。方法:经伦理审核批准,取46例2型糖尿病溃疡创面患者治疗前(第1天)及治疗后(第10天)的空腹静脉血液标本和溃疡创面组织,按照临床血糖控制情况分为2组:血糖严格控制组共30例,血糖常规控制组共16例。两组患者治疗方案不做特别限制,以胰岛素治
目的:分析并了解胃息肉患者临床特点及不同病理类型胃息肉的相关危险因素,提高对胃息肉的认识及诊断,探讨如何更好地早期发现、早期治疗及早期预防,同时为临床胃息肉患者的治疗提供理论参考依据。方法:(1)回顾性分析2017年1月1日至2020年6月30日在右江民族医学院附属医院行电子胃镜及病理检查确诊为胃息肉患者的临床数据共274例,按照不同病理类型分为腺瘤性息肉组(adenomatous polyps,
如何提高课堂40分钟的教学效果呢?我认为应着眼于精备、细备教案,巧妙地多渠道地设制每节课的课眼,以一节课的精要之处,牵动40分钟,在传授知识的同时,培养学生的思维能力,想象能力,不失为一种切实可行的方法,下面谈谈几种课眼的设置:
会议
目的:明确脂多糖(Lipopolysaccharide,LPS)对人肺泡上皮细胞株A549细胞自噬的影响,初步探讨高迁移率族蛋白B1(High mobility group box-1 protein,HMGB1)和腺苷酸活化蛋白激酶(AMP-actvated protein kinase kinase,AMPK)信号通路在A549细胞自噬中的调控作用及机制,从细胞层面初步揭示肺泡上皮细胞自噬在L
作文是初中语文教学中的一个重点和难点,而丰富和强化写作素材的积累,则是提升写作效率及质量的一个关键和有效手段。本文着重提出初中语文作文教学中积累写作素材的方法,包括从生活中积累、从阅读中积累、从写作中积累以及从媒介中积累,以期为今后教学提供指导。然而,当前初中生作文写作素材积累较少,
期刊
采用气相色谱-质谱联用法分析了浓香型白酒酒醅中主要风味物质及其空间分布的差异,通过主成分分析法探究了酒醅在发酵过程中的主要的风味物质及其前体物的变化规律。结果表明:浓香型白酒酒醅的主要风味物质有38种,其中包括18种酯类物质,10种醇类物质,8种酸类物质,2种白酒有益因子(4-甲基愈创木酚和4-乙基愈创木酚)。在酒醅不同空间层,上层的风味物质仅有18种,但酸类和酯类比例更为协调,且丁酸乙酯与己酸乙
文章以藏文手写乌梅体辅音字母为研究对象,构建一个小样本图像数据集,共包含30个类别,每类有13个样本。分析藏文手写乌梅体字符特征基础上,利用灰度化、尺寸归一化、二值化和取反、位置对齐、图像细化和主轴方向校正等方法首先对乌梅体字体进行预处理,再利用Hu不变矩和Hog特征法提取手写体字符特征。实验表明,在预处理中图像细化(骨架提取)和主轴方向校正等常用的预处理方法并不能提高手写乌梅体字母识别率,而位置
目的:(1)验证影响非瓣膜性心房颤动发病的危险因素;(2)探讨SYNE2基因突变与非瓣膜性心房颤动的发病相关性;(3)评估SYNE2基因突变位点的致病性和有害性,验证SYNE2基因突变位点的基因保守性,完善非瓣膜性房颤的发病机制。方法:(1)以2018年8月到2019年12月在右江民族医学院附属医院住院治疗的100例非瓣膜性心房颤动患者作为实验组,与110例同期住院的非房颤的患者作为对照组,总合计
目的:分析左侧卧位腹腔镜手术治疗III、Ⅳ级肝右后叶外伤的可行性、安全性及其疗效。方法:回顾性分析2013年1月至2019年12月右江民族医学院附属医院肝胆外科手术治疗的III、Ⅳ级肝右后叶外伤患者临床资料。按手术方式分为左侧卧位腹腔镜手术组和开腹手术组。比较两组患者基线资料:年龄、性别、收缩压、舒张压、心率;受伤情况:受伤时间、受伤原因、合并伤、肝损伤等级;术中情况:腹腔积血量、输血例数、术中修
目的:探究缺氧微环境下HIF-1α基因和RACGAP1基因对人肝癌细胞系Huh-7与Hep3B细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭的影响及其之间的调控关系。方法:构建人肝癌Huh-7与Hep3B细胞缺氧模型。实验设立空白对照组(control)、无义质粒组(LV-OE-NC、LV-RNAi-NC)、HIF-1α敲减组(LV-HIF-1α-RNAi)、RACGAP1敲减组(LV-RACGAP1-RNAi)、H