自我国制定信息化发展战略以来,国家将信息化建设作为重中之重,对信息建设资金的倾注与日俱增,各地信息化发展兼程并进。随着系统项目数量越来越多,系统整体规模的越来越大,信息系统审计是保证信息化健康发展的必然要求。信息系统审计是我国目前较为新颖,也是较为复杂的审计类型。当前我国行政事业单位的信息系统存在信息孤岛、条块分割等问题,为了打破信息壁垒,实现系统连通、数据共享以及功能优化,最终提高行政事业单位的管理能力和服务水平,审计机关有必要将行政事业单位信息系统整体作为审计对象,进行专门的审计调查。目前A省已经着手展开初步的信息系统专项审计,但在审计方案内容的制定上存在一些缺陷,如对系统整合与信息资源共享方面的审计不够深入、出现重复性的审计事项等。为了纾解审计内容的不足,本文基于关键审计指标对行政事业单位信息系统审计内容进行优化。首先,阐明指标构建的依据与原则,以我国信息系统审计规范、政策文件为主要依据,以案例单位中审计内容的不足等为修正依据;然后从系统的计划、构建、运行、监控四个阶段构建关键审计指标;最后,本文运用关键审计指标对X单位二次审计,并从发现问题的范围、详略程度、审计建议的可操作性三方面分析前后审计结果的差异,从而检验指标的合理性。