生物进化研究是生命科学研究的一个重要课题,进化研究的一个重要方法就是构建物种系统发育树.该文根据熵的含义引入相对熵指标,衡量物种之间进化距离.基于距离矩阵方法,构建了进化系统发育树模型.利用本模型,我们首先选用64种脊椎动物的线粒体DNA序列为材料,得到与传统的根据物种形态构建的系统树基本一致的树形.为了测试模型的适用性,进而进行了全基因组序列层次的物种进化的研究.选取长度约为线粒体DNA序列102倍的12种古生菌、真细菌全序列,得到了合理的系统树.最后将研究对象选取为直系同源簇序列,将同功能类的编码序列片断连接成为一个整体的功能序列,然后对43种物种进行系统发育树构建,这一尝试也获得了有意义的结果.该文一共分为五章.第一章引言部分,主要介绍生命科学,特别是以分子生物学为标志的近代生物学的重要成就.这是对该文所研究领域的背景的一个全面描述.第二章为熵理论概述,主要介绍了从热力学熵到信息熵、复杂性熵的基本理论以及相互之间的关联.这是产生该文工作想法和建立模型的理论基础.第三章为模型和模型检验部分.细致说明了该文根据相对熵定义的进化距离公式的形式、含义、实现方法以及该模型具体实现的操作方法,以及模型对三种序列应用的阐述.第四章为总结和讨论部分,对该文工作的结果进行总结,同时对该文研究中遇到的一些深层问题提出分析和思考.