县域经济是我国经济的重要基础。近年来,县域内发展条件的异质化与产业发展的趋同化导致重复投入、恶性竞争的问题。主体功能区战略为县域经济提供了清晰可行的发展思路。为此,应改变大而全的发展思路,根据各地的比较优势,培育差异化的主导产业,推动县域主体功能区发展。区域主导产业是区域比较优势的产业化,是区域主体功能的实现路径。本文基于县域内发展条件的异质化和碎片化特征,以曲阜市为例,以主体功能区为视角,研究县域主导产业的发展问题,对于细化主体功能分区、强化主体功能、丰富乡村产业振兴的内容、促进县域经济协调发展具有重要的意义。本文按照“理论基础—功能依据—产业选择—产业效应—政策建议”的总体思路研究县域主导产业发展问题。首先对主导产业和主体功能区的含义进行科学界定,阐述相关理论,研究主导产业与主体功能区的关系,为本研究奠定理论基础;其次,研究相关功能区规划的内容及对曲阜市各类区域的功能定位,作为曲阜市主导产业分析的功能依据。研究认为,曲阜市城区、重点乡镇和经济园区为重点开发区域,应以工业品和服务产品提供为主体功能,除重点开发和极小的禁止开发区域外的县域大部分地区为限制开发区域,以农产品和生态产品提供为主体功能;第三,从生产要素、产业基础、经营主体、市场需求等方面分析曲阜市主导产业选择的现实条件,认为曲阜市应培育比较优势突出、主体功能显著、体现“产业+生态/绿色+旅游+文化”总体特征的主导产业;第四,运用区位商等方法研究主导产业发展的效应,表明曲阜市农业基本呈现出稳中有升的态势,其中种植业最重要,但工业总体的主导地位不突出,也没有形成优势明显的工业主导产业类别,服务业是专业化水平较高的部门;第五,研究主导产业发展发展存在的问题及原因,认为以镇街辖区确定主体功能区不利于突出主体功能,主导产业多变不利于真正形成主导产业,主导产业同质化不利于实现产业化发展,其原因在于以镇街辖区确定主体功能区的“利”“弊”,对“以经济建设为中心”理解的偏差与固化,经济管理权限与资源分配的城市化、工业化导向,以及限制类功能区主导产业的正外部性与经济功能的矛盾;最后,从功能区划分与整合、主导产业调整与产业化发展、招商引资机制构建、政府投入与引导、政府绩效考核体系建立等方面提出促进县域主导产业发展的政策建议。