骨肉瘤中LKB1基因突变及其与临床病理因素的相关性研究

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目的:本研究通过检测LKB1基因在骨肉瘤细胞中的突变情况,结合检测结果分析其与骨肉瘤患者相关的临床、病理因素之间的相关性,为评估骨肉瘤患者的预后及其基因靶向治疗提供理论可行性。方法:1.选取2010年01月—2017年5月期间在深圳市第二人民医院骨肿瘤中心接受规范化手术治疗的28例原发性骨肉瘤患者骨肉瘤组织样本(经典型骨肉瘤),并从组织标本中提取DNA。2.按照Life Technology Cancer Panel标准技术流程,对提取的DNA样本使用多重PCR富集,将得到DNA片段进行纯化并建库之后在Ion Torrent测序仪上进行测序。3.结合已采集的患者临床资料,采用SPSS 19.0软件及Fisher确切概率法探讨LKB1基因突变情况与患者年龄、性别、肿瘤部位、临床Enneking分期、复发和肺部转移情况、病理分型及碱性磷酸酶水平之间的相关性,采用Kplan-Meier及log-rank检验进一步分析LKB1基因突变情况和骨肉瘤患者5年生存率之间的关系,并应用GraphPad Prism6.0软件做生存函数曲线图。结果:1.28例骨肉瘤标本组织中LKB1基因有17例发生突变,其突变率达60.71%。而所有标本组织中均存在两个共同的突变位点,即9号染色体的122031位点及1223125位点发生了突变,122031位点的突变方式均为碱基T突变成了碱基C,而此突变位点位于内含子内区域,而1223125位点的突变方式均为碱基C突变成了碱基G,此突变位点位于外显子区域。以上两个突变位点在GATK(二代测序分析软件)的统计分析下对其突变的可靠性评估结果分别得出:122031位点突变假阳性较低,突变可靠;而1223125位点突变假阳性较高,突变不可靠,予以剔除。2.在存在肺部转移灶亚组中18例患者中15例出现了LKB1基因突变,其突变率高达83.3%,而无肺部转移灶亚组中10例患者中4例出现了突变,其突变率为40.0%。3.LKB1基因突变率在患者性别、年龄、肿瘤部位、病理性骨折、碱性磷酸酶升高情况、Enneking外科分期、复发及病理类型亚组间突变率无明显差异(p>0.05),生存函数曲线显示LKB1突变与骨肉瘤患者的五年生存率有关(p<0.05)。结论:骨肉瘤患者中LKB1突变可能与肺部转移有关;LKB1基因突变可能是骨肉瘤患者不良预后的一个因素;LKB1基因有可能成为骨肉瘤基因治疗和靶向治疗的一个潜在靶点。
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