稀土尘肺患者血浆中lncRNA和miRNA差异表达及相关ceRNA调控网络分析研究

来源 :内蒙古科技大学包头医学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:cai2001m
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第一部分稀土尘肺患者血清TNF-α、IL-1β、MCP-1、HYP检测结果分析目的检测稀土尘肺患者血清中TNF-α、IL-1β、MCP-1、HYP的含量,探讨稀土尘肺早期诊断的敏感性指标。方法选择某稀土冶炼厂26名稀土尘肺患者作为稀土尘肺组,选择同期参加健康体检的不接触稀土粉尘的47人作为对照组,抽取空腹静脉血5ml,采用ELISA法进行血清TNF-α、IL-1β、MCP-1、HYP表达水平检测。结果稀土尘肺患者血清中IL-1β、HYP水平高于对照组,TNF-α、MCP-1水平低于对照组(t TNF-α=-2.199,t IL-1β=2.884,t MCP-1=-3.280,t HYP=5.014,P<0.05);在稀土尘肺组中,IL-1β、MCP-1随着年龄的升高,表达水平逐渐上升(t IL-1β=-2.746,t MCP-1=2.873,P<0.05);吸烟组患者血清中IL-1β的表达水平高于非吸烟组(t IL-1β=-2.336,P<0.05),其余三项指标的差异无统计学意义;HYP随着稀土尘肺期别的升高,表达水平逐渐上升(t HYP=3.439,P<0.05);工龄在<12年组患者血清中IL-1β、MCP-1、HYP表达水平低于工龄在12~年组(t IL-1β=2.910,t MCP-1=2.859,t HYP=2.751,P<0.05);HYP表达水平在排除年龄、吸烟、期别三个混杂因素后,与工龄呈正相关(t HYP=2.257,P<0.05)。结论TNF-α、IL-1β、MCP-1、HYP在稀土尘肺患者血清中差异表达,对稀土尘肺的病情发展有重要意义,HYP可作为早期辅助诊断稀土尘肺的敏感性指标。第二部分稀土尘肺患者血浆中lncRNA和miRNA差异表达及相关ceRNA调控网络分析研究目的探讨稀土尘肺患者血浆中lncRNA、miRNA、m RNA的差异表达谱,构建lncRNA-miRNA-m RNA ceRNA调控网络,为进一步研究稀土尘肺发病机制提供线索。方法选择稀土尘肺组和对照组各9人抽取血浆,进行lncRNA、miRNA、m RNA的测序分析;使用GO、KEGG分析对差异表达的lncRNA、miRNA、m RNA进行分析;并构建lncRNA-miRNA-m RNA ceRNA调控网络;使用q-RT-PCR进行验证;利用STRING数据库构建差异基因的蛋白质相互作用网络;通过Onco Lnc在线平台对PPI网络分析得到的分值排名前五的m RNA,以及差异表达的lncRNA、miRNA在肺癌中的生存分析进行研究。结果在稀土尘肺患者的血浆中,有125个差异表达的lncRNA(上调49个,下调76个),5个差异表达的miRNA(全部为下调)和82个差异表达的m RNA(上调38个,下调44个)。GO分析发现,差异表达的lncRNAs主要富集的条目为细胞对细胞外刺激的反应、平滑肌细胞增殖的负调控、Polo样激酶活性等;差异表达的miRNAs主要富集的条目为调节GTP酶活性、DNA修复、离子迁移等;差异表达的m RNAs主要富集的条目为跨膜信号传导受体活性、自噬空泡形成、通过剪接体对核m RNA剪接、细胞对细胞外刺激的反应等。经KEGG分析,差异表达的lncRNAs主要富集的戊糖和葡萄糖醛酸酯的相互转化、果糖和甘露糖代谢、剪接体等;差异表达的miRNAs主要富集的Hedgehog信号通路、c AMP信号通路、甘油脂代谢、泛酸和Co A生物合成等;差异表达的m RNAs主要富集在自噬调节、Notch信号通路、造血细胞谱系等。构建了lncRNA-miRNA-m RNA ceRNA调控网络,q-RT-PCR对部分差异表达的RNA的检测结果与测序结果趋势相同,测序结果可靠。在肺鳞癌中,hsa-mi R-16-2-3p和KRR1的表达水平与患者总生存率成正相关,P<0.05;在肺腺癌中,CEP83-AS1的表达水平与患者总生存率成正相关,SNW1的表达水平与患者总生存率成负相关,P<0.05。同时还发现125条差异表达的lncRNA中有56条在睾丸中存在分布表达。结论稀土尘肺患者血浆中共有125条lncRNA、4条miRNA、82条m RNA差异表达。RNA的差异表达主要与细胞对刺激的反应有关;富集的主要通路有Notch信号通路、自噬调节通路。稀土尘肺中lncRNA-miRNA-m RNA ceRNA调控网络的构建揭示了稀土尘肺在发生发展中多种关键lncRNA、miRNA、m RNA间的相互作用关系。稀土粉尘可能对工人生殖系统造成损伤。
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