2008年全球性经济危机对任何国家或政府都是一次严峻的考验,面临这样的考验,我国政府充分发挥宏观调控作用,中央安排了约4万亿元投资以扩大内需、促进经济平稳较快增长,投资涉及安居工程、农村基础设施、铁路、公路和机场等重大交通设施建设等。而目前我国政府公共工程投资损失、浪费比较严重,低水平重复建设,投资绩效并不理想。面对这些情况,审计机关要加强对政府公共工程投资进行绩效审计。政府公共工程投资绩效审计是接受“政府”委托的审计机构或审计人员对政府的工作进行审计,审计机关独立性严重不足;另外,工程项目审计不同于一般的财务审计,涉及的范围广泛,资金数额大,对审计人员的专业素质、分析判断能力有很高的要求,并且公共工程项目主要考虑的是公众的需要,对其的评价应该更全面、更深入,而目前我国对公共工程项目绩效评价的研究比较少,特别是缺乏系统全面的评价体系。这样给我国公共工程投资绩效审计带来了一定的难度。本文正是基于政府扩大投资拉动内需的环境背景,针对我国政府公共工程投资绩效审计的现状与存在问题,试图经过研究提出自己的对策建议,并构建适合我国国情的评价指标体系。本文首先从委托代理理论、公共工程投资理论和绩效审计理论角度进行分析,阐述公共工程投资项目的含义,特征,绩效审计的内容,目标等以深入分析公共工程投资项目绩效审计的理论基础;其次根据我国公共工程投资绩效审计的现状分析绩效审计取得的成绩和存在的问题,并提出自己的对策建议;最后,笔者根据上面的分析,重点对绩效审计方法、绩效审计评价标准和适合我国国情的指标体系等与政府公共工程绩效审计相关的核心问题进行了创新性的研究,并以黄河下游防洪工程项目绩效审计为例进行分析,验证了公共工程绩效审计评价指标体系的可行性。政府公共工程项目的投资不仅关系我国基础设施的建设,而且关系国家的经济安全、国防安全和人民基本生活水平的改善,因此对公共工程投资的绩效审计,在注重经济效益的前提下,更要关注社会效益、环境效益。对社会效益、环境效益和公平性的评价是绩效审计面临的问题,也是以后需要进一步研究的方向。