基于生物信息学分析研究CENPM在肝癌中的表达与临床参数以及肿瘤中淋巴细胞浸润的关系

来源 :厦门大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wangaimin143074
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:探索着丝粒蛋白M(Centromere protein M,CENPM)在肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)患者中潜在的诊疗和预后价值。方法:首先,在公共数据库Oncomine,GEPIA中分析CENPM在肝癌组织与正常肝组织中mRNA表达情况。通过GEPIA和Kaplan Meier plotter数据库分析CENPM表达与患者肿瘤病理分期和预后之间关系,cbioportal数据库研究CENPM突变情况,TISIDB数据库中分析CENPM表达与肿瘤浸润淋巴细胞(Tumor-infiltratinglymphocyte,TIL)的关系。最后收集20例在本院确诊为HCC患者样本进行免疫组化染色,初步验证CENPM蛋白质在肝癌中的表达情况。结果:Oncomine分析结果显示,与非肝癌组织相比,肝癌组织中CENPM mRNA水平显著升高,差异倍数(FC)范围为2.173-3.651。CENPMmRNA水平与肝癌患者肿瘤分期显著相关(p<0.001)。cbioportal显示CENPM发生突变的概率<0.1%(1/1487)。Kaplan Meierplotter 结果示 CENPMmRNA 表达水平升高的患者其总生存期(OS),无进展生存期(PFS),无复发生存期(RFS)及疾病特异性生存期(DSS)都显著短于低表达者(p<0.05)。而且,在无饮酒和无肝炎病毒感染的男性患者中CENPM mRNA水平更高者,OS越差(p<0.05)。TISIDB数据库显示与CENPM表达水平呈显著正相关的前5种淋巴细胞分别是活化的CD4+T细胞(Rho=0.484,p=2.2e-16)、γδT细胞(Rho=0.146,p=0.00487)、CD56dim 自然杀伤细胞(Rho=0.141,p=0.00633)、2 型辅助 T 细胞(Rho=0.121,p=0.0191)和活化的CD8+T细胞(Rho=0.105,p=0.0426)。呈显著负相关的前5种淋巴细胞分别是嗜酸性粒细胞(Rho=-0.357,p=1.74e-12)、1型辅助T细胞(Rho=-0.238,p=3.65e-06)、未成熟树突状细胞(Rho=-0.194,p=0.000173)、浆细胞样树突状细胞(Rho=-0.188,p=0.000271)和自然杀伤细胞(Rho=-0.18,p=0.000475)。临床标本免疫组化染色结果示:20例患者中16例CENPM蛋白质(16/20)在癌组织中过表达,4(4/20)例患者癌组织中未见明显过表达。结论:CENPMmRNA及蛋白质在肝癌组织中存在过表达,与多种肿瘤浸润淋巴细胞丰度存在密切联系,且过表达的CENPM与患者肿瘤分期和不良预后显著相关。CENPM可能是HCC潜在的诊疗和预后生物标记物。
其他文献
介绍了γ-氨基丁酸(GABA)的理化特性与合成途径,综述了GABA的生物学功能及其在发芽糙米中的富集方法,探讨了富含GABA发芽糙米的开发价值,为生产富含GABA的发芽糙米以及农产品的深加工提供借鉴和参考。高GABA稻米品种的选育及其内在分子机制的挖掘是今后的研究重点之一。基于发芽糙米并未广泛普及的现状,指出提高发芽糙米中活性物质含量的同时还应改善其适口性,有针对性地开发以发芽糙米为原料的功能性产
期刊
党的“十九大”报告中提出“加快生态文明体制改革、建设美丽中国”的目标,其首要任务是推动绿色发展。在城市发展范畴,绿色发展着眼于生态、宜居、高效、集约等方面,并体现在土地利用层面。轨道交通作为城市的重要组成部分,也是城市发展的重要推动力。针对现阶段城市轨道交通站点存在的开发建设弊端,以重庆广阳湾智创生态城18座轨道交通站点为例,将绿色发展理念与土地利用效率相结合,以提升轨道交通站点周边土地利用效率和
期刊
中国拥有世界上最大的海水养殖产业,是海洋经济的重要组成部分。随着我国海水养殖业快速发展,其养殖规模不断扩大,集约化养殖程度不断加深,由寄生虫病害频发,严重危及海水养殖业的绿色发展。针对传统化学方法使用浓度高、作用时间长、药物残留以及消毒副产物,影响养殖鱼类健康以及危害海洋环境安全等问题,在福建省宁德市三都澳海域中国大黄鱼基地,利用大气压强电离放电高效生成羟基自由基(·OH)的产生设备,开展了·OH
学位
目的:探讨中药熏洗联合常规护理对肛周脓肿术后患者的影响。方法:选取2017年1月—2021年1月泗洪县中医院收治的104例肛周脓肿术后患者为研究对象。根据随机数表法将其分为常规组和观察组,各52例。常规组术后给予常规护理,观察组术后给予中药熏洗联合常规护理。比较两组术后恢复情况,术后15 d排便功能,临床疗效及术后并发症。结果:观察组术后住院时间、创面愈合时间均短于常规组(P<0.05)。术后15
期刊
背景:系统性红斑狼疮(systemiclupuserythematosus,SLE)是一种好发于女性的系统性自身免疫性疾病,以免疫复合物沉积和自身抗体产生为主要特征,涉及多种异常的先天性和适应性免疫反应。SLE的发病机制复杂有研究认为遗传和环境等多因素共同作用导致机体的免疫稳态被打破,从而产生自身抗体,免疫应答过度,最终导致器官和组织损伤由于SLE特殊的性别倾向,因此雌激素系统通常被认为是导致疾病
学位
目的:1、明确咽喉反流性疾病(laryngopharyngeal reflux disease,LPRD)与喉咽部微生物组学变化的相关性。2、明确咽喉部相关危险因素与喉咽部微生物组学变化的相关性。方法:对耳鼻咽喉头颈外科门诊可疑LPRD的患者采用反流症状指数评分量表(reflux symptom index,RSI)和反流体征评分量表(reflux finding score,RFS)进行评分,并
学位
改革开放以来,随着我国经济建设速度不断增加,国内工程项目建设规模、数量也一直处于增加趋势,为人民生活质量提高做出了积极贡献。项目建设数量的增加势必会提高投资金额数目,因此应加强对项目竣工结算和审计工作的重视程度,从而提高工程造价的合理性与规范性,维护投资方的经济利益,本文将探讨工程总承包项目竣工的结算与审计。
期刊
背景:肾细胞癌是肾脏最常见的恶性肿瘤,由于肾脏具有强大的代偿能力,故早期肾癌常无明显的症状及体征,约1/3患者在确诊时已是局部进展期肾癌或合并远处转移,这部分病人术后复发率高,甚至不少在发现时已经丧失手术机会。新辅助分子靶向治疗在一些研究中被证实能改善患者预后并提高总体生存及无瘤生存,但目前仍缺乏大样本、多中心的随机对照试验来提供可靠的结论。目的:采用meta分析评价新辅助分子靶向治疗对进展期肾癌
学位
<正>2022年丙烯酸市场价大幅下跌,均价从1.32万元/t跌至6 800元/t,跌幅达48.48%。2023年丙烯酸行业新产能增速将超过10%,供应宽松或将倒逼落后产能逐渐退出市场,行业集中度将进一步提升,市场面临压力。(1)新增产能将集中投产2023年丙烯酸产能增幅约15%,这是继2015年后行业产能首次出现两位数增长。新增产能集中兑现,将从供应端给丙烯酸市场带来压力。
期刊
在多环芳烃(Polycyclic Aromatic Hydrocarbons,PAHs)污染的土壤中,甲基菲(Methylated Phenanthrene,M-Phe)是含量最多的一类烷基化多环芳烃(Alkylated PAHs,A-PAHs)。由于部分M-Phe的生物持久性、毒性均强于菲(Phenanthrene,Phe),给生态环境和人类健康带来潜在的威胁。另外,实际环境中M-Phe和母环P
学位