香菇是我国主要的食药用菌，是生产区域最广泛、总产量最高、经济效益最大的主要栽培菇类。在香菇的产业发展中，品种选育是产业健康，稳定发展的保证。香菇在后代中的遗传分化研究在育种研究中更是必不可少的。　　 本试验在前人进行的香菇育种的基础上，对香菇杂交新菌株“申香16”自交S1代菌丝生长速度、发育期、产量等性状指标的遗传分化进行研究，旨在揭示供试材料的遗传背景，总结其后代的遗传变异规律，拓宽香菇育种手段，丰富香菇种质资源。并对其后代的数量性状进行统计学分析，找出各性状之间的相互联系，提高育种效率。最后对香菇废菌糠情况进行统计分析。得出如下结论：　　 1.从自交S1代的遗传规律来看，自交导致后代群体的菌丝生长速度、发育期、产量等性状均表现出劣势现象，但性状出现了广泛分离，出现了少数超亲个体。产菇数、产量和单菇重三个指标在后代的变异系数较大，特别是总菇数的变异系数达到了77.91％，表明了该性状指标在后代中的遗传潜力相对较大。此外，自交S1代中，菌株的转色情况、子实体颜色也发生了较大的性状分离。少数(6.63％)没有转色的菌株产量较低。　　 2.对自交S1代19株高产菌株的产量、生长速度、发育期等试验结果进行对比分析和显著性检验，发现142号菌株在PDA平板上的菌丝生长速度最大，为4.67mm/d，比亲本高12.29％，与亲本和大部分高产菌株都有显著性差异。高产菌株在木屑中的菌丝生长速度都显著慢于亲本。各高产菌株之间以及与亲本之间在原基期和采收时间这两个性状上没有显著性差异。66号菌株单产最高，为822.41g，比亲本单产高出9.78％，与亲本无显著性差异。　　 3.对自交S1代数量性状进行相关性分析、通径分析及因子分析，得知Ⅰ.鲜菇单产与总菇数存在着极显著的正相关，与木屑中菌丝生长速度存在着显著的正相关，与平均菇重、原基期、采收时间存在着极显著的负相关。结果表明，木屑培养基中的菌丝生长速度、原基期、采收时间可以作为对鲜菇单产进行选择的间接指标之一。Ⅱ。原基期、采收时间、菇数、单菇重对鲜菇单产的通径分析得出，菇数对鲜菇单产的正效应最大，在育种过程中，应突出对菇数的选择，兼顾菇体大小适中。采收时间期对鲜菇单产的负效应比原基期大。Ⅲ.因子分析表明自交S1代8个数量性状可以分为弱相关的5个主因子，其方差累计率在93.8％。按照主因子所包含的性状和反应的生物学含义，对其进行命名，并根据方差贡献率大小进行排序：F1产量因子、F5发育期因子、F3木屑中菌丝生长因子、F4 PDA中菌丝生长因子、F2酶活因子，从主因子出发进行香菇育种，可以提高选择效率。　　 4.对自交S1代出菇后的废菌糠进行统计分析发现，菌株产量与菌株的抗杂菌能力没有很大的相关性，但菌株产量与氮源的消耗量存在着显著的正相关。可以以此作为调整香菇培养基配方的一个依据。　　 本文对香菇申香16自交S1代数量性状等方面做了初步探索，总结了部分性状间的遗传规律和相互关系，通过自交揭示了亲本的遗传背景。此外对自交后代表现较优菌株进行进一步选育，待优良性状稳定一致后，也可能升级为品系或品种。