中国荷斯坦牛CSN3、ACACA基因多态性及其与泌乳性状的关联性分析

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本试验以中国荷斯坦牛为研究材料,选取CSN3(κ-酪蛋白)、ACACA(乙酰辅酶A羧化酶α)2个与泌乳性状相关的候选基因,通过PCR结合产物直接测序的方法来检测突变位点,并依此确定基因型;根据SNP发生频率,使用POPGENE软件计算遗传参数;使用HAPLOVIEW软件对发现的2个基因的SNP位点进行连锁不平衡分析及单倍型分析。通过SPSS软件分别对两个基因的多态性与泌乳性状进行相关性分析。本试验旨在利用候选基因的方法筛选出对中国荷斯坦牛泌乳性状有重要影响的分子标记位点,确定影响泌乳性状的主效基因,为中国荷斯坦牛标记辅助育种及其泌乳性状遗传改良提供理论依据。研究结果表明:1.本试验在中国荷斯坦牛CSN3基因上共检测到4个SNPs位点,分别为g.463G>A,g.1012A>C,g.2015T>A和g.2396G>T,除了g.2396G>T外,其余3个SNPs位点在乳成分方面与中国荷斯坦牛密切相关。具体来说,在g.463G>A处的突变可以极显著影响乳脂率(P<0.01),不同基因型对乳蛋白率也有显著影响(P<0.05),g.1012A>C处的突变可以极显著影响乳脂率(P<0.01),而g.2015T>A处的突变对乳脂率和乳蛋白率都有极显著的影响(P<0.01)。对CSN3基因的4个SNPs位点进行双倍型关联性分析发现,H14H14(ACAG-ACAG)在乳脂率方面显著高于其他双倍型(P<0.05)。由于CSN3基因编码的κ-酪蛋白是乳蛋白的主要组成部分,SNP位点的不同基因型的CSN3基因会出现差异性表达最终影响泌乳性状。2.本试验在中国荷斯坦牛ACACA基因上检测到2个SNPs(g.43569T>C,g.43617T>G),两个SNPs位点都对中国荷斯坦牛泌乳性状有一定影响。其中,g.43569T>C处的突变可以极显著影响乳蛋白率和乳糖率(P<0.01),显著影响乳脂率(P<0.05);g.43617T>G处的突变显著影响乳蛋白率和乳糖率(P<0.05)。双倍型关联性分析发现,H1H1(CG-CG)在乳脂率方面极显著高于其余双倍型(P<0.01),在乳糖率方面显著高于其他双倍型(P<0.05)。由于ACACA基因在乳腺组织中脂肪酸合成方面发挥重要作用,SNP位点的不同基因型的ACACA基因会出现差异性表达最终影响泌乳性状。因此可以尝试将CSN3、ACACA基因作为影响泌乳性状的主效基因用于标记辅助选择,为中国荷斯坦牛选育工作提供科学依据。
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