【摘 要】
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肉鸡腹脂率性状的遗传改良一直是肉鸡性状选育的难点,由于腹脂沉积性状在活体难以精确观测,故应用传统的育种方法难以奏效。本研究选取前期筛选的影响慢速型黄羽肉鸡腹脂沉积的关键基因,进一步分析相关基因的变异对慢速型黄羽肉鸡腹脂率性状的影响,进而鉴定与慢速型黄羽肉鸡腹脂率性状关联的SNPs,为慢速型黄羽肉鸡腹脂率性状的分子标记辅助选择奠定基础。本研究首先选择了11个与慢速型黄羽肉鸡腹脂率相关的候选基因。选取
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肉鸡腹脂率性状的遗传改良一直是肉鸡性状选育的难点,由于腹脂沉积性状在活体难以精确观测,故应用传统的育种方法难以奏效。本研究选取前期筛选的影响慢速型黄羽肉鸡腹脂沉积的关键基因,进一步分析相关基因的变异对慢速型黄羽肉鸡腹脂率性状的影响,进而鉴定与慢速型黄羽肉鸡腹脂率性状关联的SNPs,为慢速型黄羽肉鸡腹脂率性状的分子标记辅助选择奠定基础。本研究首先选择了11个与慢速型黄羽肉鸡腹脂率相关的候选基因。选取56个广西灵山鸡、矮脚黄鸡、麻黄鸡、杏花鸡、隐性白羽洛克鸡5个品种的高、低腹脂率两尾样本,采用PCR产物直接测序的方法筛选候选基因3’侧翼区及部分编码区中的SNPs信息。然后以有腹脂率性状记录的100日龄广西灵山鸡群体为研究材料,采用飞行时间质谱法对候选SNP位点进行基因分型,并进行各位点基因型与腹脂率性状的关联分析,获得与腹脂率显著相关的SNPs。主要结果如下:(1)在5个鸡品种中共选择了56个高、低腹脂率两尾样本。通过PCR产物直接测序,在各候选基因3’侧翼区及部分编码区中共获得了63个候选SNP位点。(2)通过飞行时间质谱分型技术,在500只有腹脂率性状记录的广西灵山鸡群体中对候选基因SNP位点进行基因分型检测。剔除分型失败、最小等位基因频率小于0.05、偏离哈代-温伯格平衡的SNPs后,对46个候选SNP位点的群体遗传参数统计分析,其中36个SNPs的多态信息含量在0.25-0.5之间,属于中度多态位点。(3)通过SPSS 21.0统计软件的单因素方差分析模型,对46个SNPs与广西灵山鸡群体腹脂率性状进行关联分析,结果显示:共12个SNPs与广西灵山鸡腹脂率显著相关(P<0.05)。这些SNPs分布在7个候选基因中,分别为ACBD5、ACSL6、APOA5、APOB、FABP1、LPIN1、SLC27A2。其中,位于ACBD5、ACSL6的3’UTR区域的SNPs共有两个;FABP1的内含子中共有4个显著SNPs;LPIN1内含子中共有2个显著SNPs;SLC27A2的内含子中共有2个显著SNPs;有两个SNPs位于候选基因外显子中,其中c.459G>A位于APOA5的外显子3中,该位点的等位基因A突变导致编码的氨基酸由谷胱氨酸改变为赖氨酸,c.246C>T位于APOB的外显子29中,该位点的等位基因T突变导致编码的氨基酸由谷胱氨酸改变为组氨酸。上述SNPs是潜在的广西灵山鸡腹脂率性状的分子标记。
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