肉制品中常见食肉目动物种源成分鉴定的靶标序列筛选与快速、精准检测方法建立

来源 :华中农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:worbestczhy
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
随着人们对肉的需求量越来越大,肉制品安全问题引起了广泛关注,一些不法商家甚至使用猫、狗、狐、水貂等常见食肉目动物的肉进行掺假售卖。据报道,猫、狗、水貂等食肉目动物具有感染和传播新型冠状病毒(Severe acute respiratory syndrome coronavirus-2,SARS-Co V-2)的风险,且是多种人畜共患病的宿主,食用这些肉容易造成疫病传播,给人们的健康带来隐患。目前已建立了多种基于物种特异性DNA序列的动物种源成分检测方法。这些方法多以线粒体DNA为靶标,容易因不同品种或个体的引物结合区域变异而造成假阴性的检测结果。而且,在对多个物种检测时需要同时使用多对引物,常因引物之间的相互作用而影响检测的效率和准确性,更难以做到同时对多种食肉目动物的现场快速检测。因而,本研究拟在核基因组上筛选猫、狗、狐、水貂特异性靶标序列,并将通用引物与RPA、实时荧光PCR相结合来建立常见的非食用食肉目动物种源成分的现场快速筛查方法以及实验室精准检测方法。主要结果如下:(1)猫、狗、狐、水貂4物种种源成分检测的靶标序列筛选:通过多物种核基因组比对分析,筛选得到一段来自狗的核基因组上的DNA序列(NC_051821.1),用作鉴定和区分猫、狗、狐、水貂的靶标序列。猫、狗、狐、水貂靶标序列的同源率都不低于80%,序列长度分别为339 bp、335 bp、335 bp和332 bp,而在其它40个非目标物种中不存在同源序列或存在同源率非常低且片段长度低于200 bp的同源序列。进一步的Clustal W多序列比对发现,猫、狗、狐、水貂靶标序列与其它物种的同源序列相比,整体上具有较高的序列差异性。仅对于猫、狗、狐、水貂靶标序列而言,四者序列两端的保守性良好,而在序列内部存在明显的碱基差异。这些特点说明猫、狗、狐、水貂靶标序列对于目标物种(猫、狗、狐、水貂)相对保守,对非目标物种来说具有良好的特异性,可用来很好的鉴定和区分猫、狗、狐、水貂。(2)猫、狗、狐、水貂4物种种源成分现场快速筛查方法的建立:在猫、狗、狐、水貂靶标序列的保守区设计了RPA的通用引物,并对RPA的反应体系和条件进行了优化。该反应可在恒温(42℃)条件下进行,仅需要30 min即可完成。通过琼脂糖凝胶电泳对RPA产物进行分析,发现仅在猫、狗、狐、水貂阳性样品中有目的条带的扩增,而在牛、羊、驴、猪、鸡等常见食用动物中均没有扩增,表明建立的RPA快速方法可用于对肉制品中猫、狗、狐、水貂种源成分进行初步筛查。只要样品中含有猫、狗、狐、水貂成分,即可被检测出来,但不能对这4个目标物种进行区分。(3)猫、狗、狐、水貂4物种种源成分实验室精准检测方法的建立:在猫、狗、狐、水貂靶标序列的保守区和变异区分别设计实时荧光PCR的通用引物和物种特异性Taq Man探针。使用单重实时荧光PCR在21个常见动物物种中对引物和探针的特异性进行了检测,结果表明引物和探针具有良好的特异性。通过对多重实时荧光PCR的反应条件和体系进行优化,确定了猫、狗、狐、水貂特异性Taq Man探针的最优比例为6:3:8:2,并建立了用于对肉制品中猫、狗、狐、水貂种源成分精准鉴定和区分的通用引物——多重实时荧光PCR(universal primer multiplex real-time PCR,UP-M-rt PCR)方法。该方法的绝对检出限为0.05 ng/μL,相对检出限为0.05%(w/w)。使用该方法对6个自制的不同掺假比例的多物种混合肉样进行检测,检测结果与实际的掺假成分完全一致,证明该方法具有极好的准确性。综上,本研究在核基因组上筛选到了可用于特异性检测猫、狗、狐、水貂的靶标序列,并建立了猫、狗、狐、水貂4物种种源成分的RPA现场快速筛查方法以及UP-M-rt PCR实验室精准检测方法,可为监管部门提供有效的技术支撑。
其他文献
DNA甲基化在鱼类、哺乳动物等脊椎动物的性别决定与性分化中起着关键作用。但在鸡性腺发育中DNA甲基化的研究极少,且大部分研究集中于雄性高甲基化区域(malehypermethylated,MHM)。目前还未有在鸡早期性腺进行全基因组DNA甲基化的分析,尚不清楚是否存在性腺组织特异性差异甲基化区域(differentially methylated region,DMR)对性别决定与性分化有调控作用
学位
骨骼肌是动物的重要组成部分,其生长发育受遗传因素与环境因素双重影响。课题组前期研究发现一个在小鼠和猪之间具有调节肌肉重量的功能保守性的新lnc RNA SYISL,敲除后其成年个体的肌纤维数目和肌肉重量显著增加,而肌纤维数目在出生前已经固定,并在出生后保持不变,推测lnc RNA SYISL可能对胚胎期初级肌纤维和次级肌纤维形成具有重要影响,但机制尚不清楚。研究表明,肠道菌群也是调节肌肉重量的关键
学位
随着社会经济的发展,大量新兴污染物出现,环境污染问题日益突出,由此也带来了一系列的健康风险,包括增塑剂、个人护理产品、农药和阻燃剂等在内的环境内分泌干扰物(Endocrine disrupting chemicals,EDCs)已被证实会导致雌性动物生殖能力下降。双酚A(Bisphenol A,BPA)作为典型的环境内分泌干扰物,常用于制造塑料制品。大量研究表明,BPA具有不可忽视的毒性和内分泌干
学位
琼北“村语”(亦称临高语、临高话、贝语)属于汉藏语系(侗台)语族(壮傣)语支。琼北“村语”历来是学术界研究的热点,对于其元音分类,各个学者的看法各不相同,且鲜有学者从实验语音研究角度分析琼北“村语”元音的声学性质,探究琼北“村语”的元音类型及自然音变链。本文通过田野调查获取点的一手数据,利用斐风软件记音,Praat软件进行标记,并用软件Voicesource进行数据处理,从而得到各个元音的音长和共
学位
猪是重要的农业经济动物,由于其体型、器官大小和人类较为接近,也被广泛应用于人类疾病研究、药物反应测试和治疗的替代模型。在基因组水平上,猪的基因序列与人类和小鼠高度相似,受限于有限的基因注释信息,猪的基因功能研究往往会参考其在小鼠或人基因组上的同源基因信息,该做法往往缺乏足够的科学依据。基因功能的发生关键在于其转录与表达,基因表达调控模式的相似性更能代表功能的相似性。先前的研究表明,功能基因往往是共
学位
氨气是一种有毒气体,主要产生于畜禽场、化肥厂或田间施肥。长期或高浓度的氨气暴露,会影响人和动物的健康,导致动物生产力下降,甚至引起个体死亡。肺是呼吸道的终末器官,在维持机体健康方面扮演重要角色。肺也是氨气的重要靶器官之一。本课题组前期研究发现,与对照组相比,15 mg/m~3和38 mg/m~3氨气刺激仔猪30天以后,仔猪肺部出现了细胞外基质成分增多、肺泡间隔增厚等结构性病变。本研究通过转录组学分
学位
在胚胎性腺中,支持细胞是最先进行分化的体细胞,其对公猪生精过程及睾丸发育具有重要作用。公猪产生精子的能力受到成熟支持细胞数量的限制,而成熟支持细胞的数量是由未成熟支持细胞的增殖活力决定的。已有部分研究表明环状RNA对支持细胞增殖或凋亡有关键调控作用,然而目前鉴定出的大部分环状RNA其功能仍是未知的。本研究鉴定了circ01801的环状结构,检测其在不同时期梅山、杜洛克与大白公猪睾丸中的表达水平,利
学位
绵羊作为短日照动物,通常在秋冬季节集中发情,在次年春天集中产羔。这种季节性繁殖的特性限制了其繁殖效率,从而极大地限制了肉羊出栏量。因此,研究季节性繁殖的内在原因至关重要。CRY基因与哺乳动物季节性繁殖密切相关,本研究以哺乳动物CRY为研究对象,分析其起源与分化,以及在季节性繁殖哺乳动物中的选择压力。从转录水平分析CRY1基因在湖羊初情期前后性腺轴中的变化,并研究了CRY1基因的核心启动子区。主要结
学位
由灰葡萄孢引起的灰霉病每年对我国果蔬生产造成严重损失,目前生产中使用化学杀菌剂仍是防治该病的主要手段。灰葡萄孢具有较高的抗药性风险,解析灰葡萄孢对杀菌剂的抗性机制和抗性快速检测技术的研发具有重要现实意义。苯胺基嘧啶类杀菌剂(APs)是一类对灰霉病高效的杀菌剂,但相关抗性机理尚不明确;苯并咪唑类杀菌剂(MBCs)是防治灰霉病的常用药剂,生产中已经产生抗性。本课题从AP类杀菌剂抗性相关候选基因功能分析
学位
鸡毒支原体(Mycoplasma gallisepticum,MG)是引起鸡慢性呼吸道病(CRD)的病原体,在世界范围内广泛流行,且常与其他病原微生物混合或继发感染,给家禽业造成巨大的经济损失。目前生产上治疗CRD的主要措施之一是使用抗生素,但抗生素极易造成耐药菌株的产生,且引起禽产品药物残留,严重威胁公众的健康。中草药具有显著的杀菌、抗炎、提高机体免疫力,且长期使用不易产生耐药性的特点,是一个替
学位